Estrategias de optimización de codones

Existen 64 codones genéticos, de los cuales 60 codifican 20 aminoácidos. Todos los organismos utilizados para la expresión o producción de proteínas (incluidos Escherichia coli, levaduras, células de mamíferos, Pichia, células vegetales y células de insectos) presentan algún grado de diferencia o preferencia en el uso de codones. Los codones que se utilizan con mayor frecuencia en un huésped se denominan codones óptimos, mientras que los que no se utilizan con frecuencia se denominan codones raros o de bajo uso.

Optimización de codones

La optimización de codones implica modificar una secuencia genética utilizando codones preferidos y evitando codones poco utilizados o raros, y luego obtener el gen modificado mediante síntesis genética. Este rediseño de genes se conoce como optimización de codones.

Una secuencia genética optimizada puede mejorar la estabilidad de la estructura secundaria del ARNm, evitando retrasos en la traducción, terminación prematura de la traducción, cambios en el marco de la traducción y desajustes de aminoácidos debido a reservas insuficientes de ARNt.

La optimización es importante porque facilita la progresión eficiente de procesos como la síntesis de genes, la construcción de vectores, la transcripción y la traducción.

Factores de optimización

Equilibrio del contenido de GC: Esto afecta la estabilidad de la unión, la temperatura de recocido y el rendimiento proteico.

Reducir secuencias repetitivas: Esto disminuye la dificultad de la síntesis genética.

Ajuste de la estructura secundaria del ARNm: Para evitar estructuras de horquilla que afecten la traducción.

Eliminación de los sitios de corte de las enzimas de restricción:Para proteger la integridad del gen.

Preferencia de codón: Optimización del gen donante según el huésped para maximizar la expresión de proteínas.

El apoyo de Yaohai

Para el diseño y la síntesis de genes, la mera expresión de proteínas y la optimización de codones no son suficientes. Diferentes métodos y programas pueden diseñar y producir diferentes secuencias de ARNm optimizadas por codones. Basándose en los factores de optimización anteriores, combinados con su base de datos oficial y resumiendo años de experiencia en síntesis de genes, Yaohai Bio-Pharma ha desarrollado su exclusiva base de datos de optimización de codones. Puede proporcionarle optimización de codones y diseño de esquemas de síntesis de genes gratuitos para maximizar la optimización de codones de su secuencia de genes.

Yaohai Bio-Pharma ha establecido un conjunto completo de tecnologías de síntesis de ARNm lineal y ARNm circular para proporcionar ARN de alta calidad, como diseño y optimización de secuencias, síntesis de genes, IVT, circularización, purificación de ARN y encapsulación de LNP.

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