Estrategias de Optimización de Codones

Existen 64 codones genéticos, de los cuales 60 codifican 20 aminoácidos. Cada organismo utilizado para la expresión o producción de proteínas (incluyendo Escherichia coli, levadura, células mamíferas, Pichia, células vegetales y células de insectos) muestra algún grado de diferencia o preferencia en el uso de codones. Los codones más utilizados en un huésped se llaman codones óptimos, mientras que aquellos que no se usan con frecuencia se denominan codones raros o de bajo uso.

Optimización de Codones

La optimización de codones implica modificar una secuencia génica utilizando los codones preferidos y evitando los codones de bajo uso o raros, y luego obtener el gen modificado a través de síntesis génica. Este rediseño de genes se denomina optimización de codones.

Una secuencia génica optimizada puede mejorar la estabilidad de la estructura secundaria del mRNA, evitando retrasos en la traducción, terminación prematura de la traducción, desplazamiento del marco de lectura y errores de emparejamiento de aminoácidos debido a pools insuficientes de tRNA.

La optimización es significativa porque facilita el progreso eficiente de procesos como la síntesis de genes, la construcción de vectores, la transcripción y la traducción.

Factores de Optimización

Equilibrar el contenido de GC: Esto afecta la estabilidad de unión, la temperatura de anejo y el rendimiento de proteínas.

Reducir secuencias repetitivas: Esto disminuye la dificultad de la síntesis de genes.

Ajustar la estructura secundaria del mRNA: Para evitar estructuras de hairpin que impacten la traducción.

Eliminar sitios de corte de enzimas de restricción : Para proteger la integridad del gen.

Preferencia de codón: Optimizar el gen donante según el huésped para maximizar la expresión de proteínas.

El apoyo de Yaohai

Para el diseño y síntesis de genes, la simple expresión de proteínas y la optimización de codones no son suficientes. Diferentes métodos y programas pueden diseñar y producir secuencias de ARN mensajero optimizadas con diferentes codones. Basándose en los factores de optimización anteriores, combinados con su base de datos oficial, y resumiendo años de experiencia en la síntesis de genes, Yaohai Bio-Pharma ha desarrollado su base de datos única de optimización de codones. Puede proporcionarle optimización de codones gratuita y diseño de esquemas de síntesis de genes para maximizar la optimización de codones de su secuencia génica.

Yaohai Bio-Pharma ha establecido un conjunto completo de tecnologías de síntesis de ARN lineal y circular para proporcionar ARN de alta calidad, como diseño y optimización de secuencias, síntesis de genes, IVT, ciclización, purificación de ARN y encapsulación LNP.

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