Estratégias de otimização de códons

Existem 64 códons genéticos, dos quais 60 codificam 20 aminoácidos. Todo organismo usado para expressão ou produção de proteínas (incluindo Escherichia coli, levedura, células de mamíferos, Pichia, células vegetais e células de insetos) exibe algum grau de diferença ou preferência no uso de códons. Os códons mais frequentemente utilizados em um hospedeiro são chamados de códons ótimos, enquanto aqueles não frequentemente utilizados são chamados de códons raros ou de baixo uso.

Otimização de códons

A otimização de códons envolve modificar uma sequência de genes utilizando códons preferenciais e evitando códons de baixo uso ou raros, e então obter o gene modificado por meio da síntese de genes. Esse redesenho de genes é chamado de otimização de códons.

Uma sequência genética otimizada pode aumentar a estabilidade da estrutura secundária do mRNA, evitando atrasos na tradução, término prematuro da tradução, deslocamento do quadro de tradução e incompatibilidades de aminoácidos devido a pools insuficientes de tRNA.

A otimização é significativa porque facilita a progressão eficiente de processos como síntese de genes, construção de vetores, transcrição e tradução.

Fatores de otimização

Balanceamento de conteúdo GC: Isso afeta a estabilidade da ligação, a temperatura de recozimento e o rendimento da proteína.

Reduzindo sequências repetitivas: Isso diminui a dificuldade da síntese genética.

Ajustando a estrutura secundária do mRNA: Para evitar estruturas em grampo que impactam a tradução.

Eliminando os locais de corte da enzima de restrição:Para proteger a integridade do gene.

Preferência de códon: Otimizando o gene doador de acordo com o hospedeiro para maximizar a expressão de proteínas.

Apoio de Yaohai

Para design e síntese de genes, a mera expressão de proteínas e otimização de códons não são suficientes. Diferentes métodos e programas podem projetar e produzir diferentes sequências de mRNA otimizadas por códons. Com base nos fatores de otimização acima, combinados com seu banco de dados oficial e resumindo anos de experiência em síntese de genes, a Yaohai Bio-Pharma desenvolveu seu banco de dados exclusivo de otimização de códons. Ele pode fornecer a você otimização de códons gratuita e design de esquema de síntese de genes para maximizar a otimização de códons de sua sequência de genes.

A Yaohai Bio-Pharma estabeleceu um conjunto completo de tecnologias de síntese de mRNA linear e circular para fornecer RNA de alta qualidade, como design e otimização de sequência, síntese de genes, IVT, circularização, purificação de RNA e encapsulamento de LNP.

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