Estratégias de Otimização de Codons

Existem 64 codons genéticos, dos quais 60 codificam 20 aminoácidos. Todo organismo utilizado para expressão ou produção de proteínas (incluindo Escherichia coli, leveduras, células mamíferas, Pichia, células vegetais e células de insetos) exibe algum grau de diferença ou preferência no uso de codons. Os codons mais frequentemente utilizados em um hospedeiro são chamados de codons ótimos, enquanto aqueles pouco utilizados são chamados de codons raros ou de baixo uso.

Otimização de Codons

A otimização de codons envolve modificar uma sequência gênica utilizando codons preferenciais e evitando codons de baixo uso ou raros, e então obter o gene modificado por síntese gênica. Essa reengenharia de genes é chamada de otimização de codons.

Uma sequência gênica otimizada pode melhorar a estabilidade da estrutura secundária do mRNA, prevenindo atrasos na tradução, terminação prematura da tradução, deslocamento de quadro translacional e desencaixes de aminoácidos devido a reservas insuficientes de tRNA.

A otimização é significativa porque facilita o progresso eficiente de processos como síntese de genes, construção de vetores, transcrição e tradução.

Fatores de Otimização

Equilibrando o conteúdo de GC: Isso afeta a estabilidade de ligação, temperatura de annealing e rendimento de proteína.

Reduzindo sequências repetitivas: Isso diminui a dificuldade da síntese de genes.

Ajustando a estrutura secundária do mRNA: Para evitar estruturas de hairpin que impactam a tradução.

Eliminando sítios de corte de enzimas de restrição : Para proteger a integridade do gene.

Preferência de codão: Otimizando o gene doador de acordo com o hospedeiro para maximizar a expressão de proteínas.

Suporte da Yaohai

Para design e síntese de genes, a simples expressão de proteínas e otimização de codões não são suficientes. Diferentes métodos e programas podem projetar e produzir sequências de mRNA com diferentes codões otimizados. Com base nos fatores de otimização acima, combinados com seu banco de dados oficial e resumindo anos de experiência em síntese de genes, a Yaohai Bio-Pharma desenvolveu sua base de dados única de otimização de codões. Ela pode fornecer otimização de codões gratuita e design de esquemas de síntese de genes para maximizar a otimização da sequência de DNA.

A Yaohai Bio-Pharma estabeleceu um conjunto completo de tecnologias de síntese de mRNA linear e circular para fornecer RNA de alta qualidade, como design e otimização de sequências, síntese de genes, IVT, ciclização, purificação de RNA e encapsulamento LNP.

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