Стратегии за оптимизација на кодони

Постојат 64 генетски кодони, од кои 60 кодираат 20 амино киселини. Секој организам што се користи за изразување или производство на протеини (вклучувајќи Escherichia coli, квасец, клетки од цицачи, Pichia, растителни клетки и клетки од инсекти) покажува одреден степен на разлика или предност во употребата на кодон. Кодоните кои најчесто се користат во домаќинот се нарекуваат оптимални кодони, додека оние кои не се користат често се нарекуваат ретки или кодони со мала употреба.

Кодонска оптимизација

Оптимизацијата на кодоните вклучува модификација на генска секвенца со користење на претпочитани кодони и избегнување на ниски или ретки кодони, а потоа добивање на модифицираниот ген преку синтеза на гени. Овој редизајн на гените се нарекува оптимизација на кодон.

Оптимизирана генска секвенца може да ја подобри стабилноста на секундарната структура на mRNA, спречувајќи одложувања на преведувањето, предвремено завршување на преводот, префрлање на рамката и несовпаѓање на аминокиселините поради недоволните базени на tRNA.

Оптимизацијата е значајна бидејќи ја олеснува ефикасната прогресија на процесите како што се синтеза на гени, изградба на вектори, транскрипција и транслација.

Фактори за оптимизација

Балансирање на GC содржина: Ова влијае на стабилноста на врзувањето, температурата на жарење и приносот на протеини.

Намалување на повторувачките секвенци: Ова ја намалува тешкотијата на синтезата на гените.

Прилагодување на секундарната структура на mRNA: За да се избегнат структурите на фиба кои влијаат на преводот.

Елиминирање на местата за сечење на рестриктивниот ензим: За заштита на интегритетот на генот.

Преференци за кодон: Оптимизирање на донорскиот ген според домаќинот за да се максимизира протеинската експресија.

Поддршка на Јаохаи

За дизајн и синтеза на гени, само протеинска експресија и оптимизација на кодон не се доволни. Различни методи и програми можат да дизајнираат и произведат различни секвенци на mRNA оптимизирани со кодони. Врз основа на горенаведените фактори за оптимизација, во комбинација со неговата официјална база на податоци и сумирање на годините на искуство со синтеза на гени, Yaohai Bio-Pharma ја разви својата единствена база на податоци за оптимизација на кодони. Може да ви обезбеди бесплатна оптимизација на кодони и дизајн на шема за синтеза на гени за да ја максимизирате оптимизацијата на кодоните на вашата генска секвенца.

Yaohai Bio-Pharma има воспоставено комплетен сет на технологии за синтеза на линеарна mRNA и кружна mRNA за да обезбеди висококвалитетна РНК, како што се дизајнирање и оптимизација на секвенците, синтеза на гени, IVT, циркуларизација, прочистување на РНК и енкапсулација на LNP.

Исто така, активно бараме институционални или индивидуални глобални партнери. Ние нудиме најконкурентна компензација во индустријата. Ако имате какви било прашања, ве молиме слободно контактирајте не: [email protected]

За повеќе детали за Yaohai Bio-Pharma, ве молиме погледнете ја нашата веб-страница: www.yaohaibio-pharma.com