Kodon Optimizasyon Stratejileri

64 genetik kodon vardır ve bunlardan 60'ı 20 amino asit kodlar. Protein ifadesi veya üretimi için kullanılan her organizma (Escherichia coli, maya, memeli hücreleri, Pichia, bitki hücreleri ve böcek hücreleri dahil) kodon kullanımında bir miktar farklılık veya tercih gösterir. Bir konakta en sık kullanılan kodonlara optimal kodonlar denirken, sık kullanılmayanlara nadir veya düşük kullanımlı kodonlar denir.

Kodon Optimizasyonu

Kodon optimizasyonu, tercih edilen kodonları kullanarak ve düşük kullanımlı veya nadir kodonlardan kaçınarak bir gen dizisini değiştirmeyi ve ardından gen sentezi yoluyla değiştirilmiş geni elde etmeyi içerir. Genlerin bu yeniden tasarımına kodon optimizasyonu denir.

Optimize edilmiş bir gen dizisi, mRNA ikincil yapısının kararlılığını artırarak, yetersiz tRNA havuzlarından kaynaklanan çeviri gecikmelerini, erken çeviri sonlanmasını, çevirisel çerçeve kaymalarını ve amino asit uyumsuzluklarını önleyebilir.

Optimizasyon, gen sentezi, vektör inşası, transkripsiyon ve translasyon gibi süreçlerin etkin bir şekilde ilerlemesini kolaylaştırdığı için önemlidir.

Optimizasyon Faktörleri

GC içeriğinin dengelenmesi: Bu durum bağlanma kararlılığını, tavlama sıcaklığını ve protein verimini etkiler.

Tekrarlayan dizileri azaltmak: Bu da gen sentezinin zorluğunu azaltır.

mRNA sekonder yapısının ayarlanması: Çeviriyi etkileyen saç tokası yapılarından kaçınmak için.

Restriksiyon enzimi kesme bölgelerinin ortadan kaldırılması: Genin bütünlüğünü korumak.

Kodon tercihi: Protein ekspresyonunu maksimize etmek için donör geninin konağa göre optimize edilmesi.

Yaohai'nin desteği

Gen tasarımı ve sentezi için, sadece protein ifadesi ve kodon optimizasyonu yeterli değildir. Farklı yöntemler ve programlar farklı kodon-optimize edilmiş mRNA dizileri tasarlayabilir ve üretebilir. Yukarıdaki optimizasyon faktörlerine dayanarak, resmi veritabanıyla birleştirilmiş ve yılların gen sentezi deneyimini özetleyen Yaohai Bio-Pharma, benzersiz kodon optimizasyon veritabanını geliştirmiştir. Gen dizinizin kodon optimizasyonunu en üst düzeye çıkarmak için size ücretsiz kodon optimizasyonu ve gen sentez şeması tasarımı sağlayabilir.

Yaohai Bio-Pharma, dizi tasarımı ve optimizasyonu, gen sentezi, IVT, sirkülerizasyon, RNA saflaştırma ve LNP kapsülleme gibi yüksek kaliteli RNA sağlamak için eksiksiz bir doğrusal mRNA ve sirküler mRNA sentez teknolojileri seti kurmuştur.

Ayrıca aktif olarak kurumsal veya bireysel küresel ortaklar arıyoruz. Sektördeki en rekabetçi tazminatı sunuyoruz. Herhangi bir sorunuz varsa lütfen bizimle iletişime geçmekten çekinmeyin: [email protected]

Yaohai Bio-Pharma hakkında daha fazla bilgi için lütfen web sitemizi inceleyin: www.yaohaibio-pharma.com