Stratégie optimalizácie kodónov

Existuje 64 genetických kodónov, z ktorých 60 kóduje 20 aminokyselín. Každý organizmus používaný na expresiu alebo produkciu proteínu (vrátane Escherichia coli, kvasiniek, cicavčích buniek, Pichia, rastlinných buniek a hmyzích buniek) vykazuje určitý stupeň rozdielov alebo preferencií v použití kodónov. Najčastejšie používané kodóny v hostiteľovi sa nazývajú optimálne kodóny, zatiaľ čo tie, ktoré sa často nepoužívajú, sa nazývajú zriedkavé alebo málo používané kodóny.

Optimalizácia kodónov

Optimalizácia kodónov zahŕňa modifikáciu génovej sekvencie využitím preferovaných kodónov a vyhýbanie sa málo používaným alebo zriedkavým kodónom a potom získanie modifikovaného génu prostredníctvom génovej syntézy. Toto prepracovanie génov sa označuje ako optimalizácia kodónov.

Optimalizovaná génová sekvencia môže zvýšiť stabilitu sekundárnej štruktúry mRNA, zabrániť oneskoreniam translácie, predčasnému ukončeniu translácie, posunu translačného rámca a nesúladu aminokyselín v dôsledku nedostatočných zásob tRNA.

Optimalizácia je významná, pretože uľahčuje efektívnu progresiu procesov, ako je syntéza génov, konštrukcia vektorov, transkripcia a translácia.

Optimalizačné faktory

Vyváženie obsahu GC: To ovplyvňuje stabilitu väzby, teplotu žíhania a výťažok proteínu.

Zníženie počtu opakujúcich sa sekvencií: Tým sa znižuje obtiažnosť syntézy génov.

Úprava sekundárnej štruktúry mRNA: Aby ste sa vyhli vlásenkovým štruktúram, ktoré ovplyvňujú preklad.

Eliminácia miest štiepenia reštrikčnými enzýmami: Na ochranu integrity génu.

Preferencia kodónov: Optimalizácia donorového génu podľa hostiteľa na maximalizáciu expresie proteínu.

Yaohaiova podpora

Na dizajn a syntézu génov nestačí iba expresia proteínov a optimalizácia kodónov. Rôzne metódy a programy môžu navrhnúť a produkovať rôzne kodónovo optimalizované mRNA sekvencie. Na základe vyššie uvedených optimalizačných faktorov v kombinácii s oficiálnou databázou a zhrnutím rokov skúseností so syntézou génov vyvinula spoločnosť Yaohai Bio-Pharma svoju jedinečnú databázu optimalizácie kodónov. Môže vám poskytnúť bezplatnú optimalizáciu kodónov a návrh schémy génovej syntézy na maximalizáciu optimalizácie kodónov vašej génovej sekvencie.

Spoločnosť Yaohai Bio-Pharma vytvorila kompletný súbor technológií lineárnej mRNA a cirkulárnej syntézy mRNA na poskytovanie vysokokvalitnej RNA, ako je návrh a optimalizácia sekvencií, génová syntéza, IVT, cirkularizácia, purifikácia RNA a enkapsulácia LNP.

Aktívne tiež hľadáme inštitucionálnych alebo individuálnych globálnych partnerov. Ponúkame najkonkurencieschopnejšiu kompenzáciu v odvetví. Ak máte akékoľvek otázky, neváhajte nás kontaktovať: [email protected]

Viac podrobností o Yaohai Bio-Pharma nájdete na našej webovej stránke: www.yaohaibio-pharma.com