Stratégie optimalizácie kodónov

Existuje 64 genetických kodónov, z ktorých 60 kódujú 20 aminokyselinami. Každý organizmus používaný na expresiu alebo výrobu bílkovín (vrátane Escherichia coli, droždiek, mäsiach buniek, Pichia, rastlinných buniek a hmyzích buniek) prejavuje istý stupeň rozdielu alebo preferencie v použití kodónov. Kodóny, ktoré sú najčastejšie používané v danom nosiči, sa nazývajú optimálne kodóny, zatiaľ čo tie, ktoré sa používajú málo, sa nazývajú redké alebo málo používané kodóny.

Optimalizácia kodónov

Optimalizácia kodónov zahŕňa úpravu postupnosti genu tak, že sa použijú preferované kodóny a vyhnutie sa málo používaným alebo redkým kodónom, a následne získanie upraveného genu prostredníctvom syntézy genu. Táto redesign génov sa označuje ako optimalizácia kodónov.

Optimalizovaná postupnosť genu môže zlepšiť stabilitu sekundárnej štruktúry mRNA, čím sa predchádza oneskoreniu prekladania, predčasnému ukončeniu prekladania, posunutiu prekladacej rámy a nezhodám v aminokyselinách kvôli nedostatku tRNA.

Optimalizácia je dôležitá, pretože umožňuje efektívny priebeh procesov ako je syntéza génu, konštrukcia vektora, transkripcia a preklad.

Faktory optimalizácie

Vyvažovanie obsahu GC: Toto ovplyvňuje stabilitu bindovania, teplotu anealingu a výnos proteínov.

Redukcia opakujúcich sa postupností: Toto zníži obtiažnosť syntézy genu.

Prispôsobenie sekundárnej štruktúry mRNA: Aby sa vyhli štruktúram hairpin, ktoré ovplyvňujú preklad.

Zrušenie striedacích miest enzýmami restrykcie : Aby sa chránila integrita genu.

Predvoľba kodónov: Optimalizácia dárcovského genu podľa hostiteľa na maximalizáciu expresie proteínu.

Podpora Yaohai

Pre dizajn a syntézu genu nie sú dostatočné iba expresia proteínu a optimalizácia kodónov. Rôzne metódy a programy môžu navrhnúť a vyprodukovať rôzne kodónovo optimalizované mRNA postupnosti. Na základe uvedených faktorov optimalizácie, kombinovaných s oficiálnou databázou a s prehliadkou rokov skúseností v syntéze génu, spoločnosť Yaohai Bio-Pharma vyvinula svoju jedinečnú databázu pre optimalizáciu kodónov. Môže Vám ponúknuť bezplatnú optimalizáciu kodónov a dizajn schémy syntézy genu na maximalizáciu optimalizácie kodónov vášho genetického postupu.

Spoločnosť Yaohai Bio-Pharma si vybudovala kompletný súbor technológií na syntézu lineárneho mRNA a kruhového mRNA na poskytovanie vysokokvalitného RNA, ako je dizajn a optimalizácia postupnosti, syntéza genu, IVT, circularizácia, čistenie RNA a LNP encapsulácia.

Hľadáme tiež aktívne globálnych partnerov, či už institucionálnych alebo jednotlivcov. Ponúkame najkonkurenceschopnejšie odškodnenie v odvetví. Ak máte akékoľvek otázky, neváhejte nás kontaktovať: [email protected]

Pre viac podrobností o Yaohai Bio-Pharma sa prosím pozrite na náš webový stránku: www.yaohaibio-pharma.com