Strategier for kodonoptimalisering

Det finnes 64 genetiske kodoner, hvorav 60 koder for 20 aminosyrer. Hvert organisme som brukes til proteinuttrykk eller produksjon (inkludert Escherichia coli, gjerst, pattedyrsceller, Pichia, planterceller og insektsceller) viser en viss grad av forskjell eller foretrukket bruk av kodoner. De kodoner som brukes mest i en vert kalles optimale kodoner, mens de som ikke brukes ofte kalles sjeldne eller lav-brukte kodoner.

Kodonoptimalisering

Kodonoptimalisering innebærer å modifisere en gener sekvens ved å bruke foretrukne kodoner og unngå lav-brukte eller sjeldne kodoner, og deretter oppnå den modifiserte genen gjennom genesyntese. Denne redesigningen av gener kalles kodonoptimalisering.

En optimalisert genesekvens kan forbedre stabiliteten til mRNA's sekundærstruktur, og forhindre oversettelsesforsinkelser, for tidlig avslutting av oversettelse, translasjonsrammeforskyvning og aminosyre-misstemmelser på grunn av utilstrekkelige tRNA-pooler.

Optimering er viktig fordi den gjør det mulig å forbedre effektiviteten i prosesser som genetisk syntese, vektorbygging, transkripsjon og translasjon.

Optimeringsfaktorer

Balansere GC-innholdet: Dette påvirker bindingsstabilitet, annealing-temperatur og proteineffekt.

Redusere repetative sekvenser: Dette reduserer vanskelighetsgraden ved genesyntese.

Juster mRNA sekundærstruktur: For å unngå hairpin-strukturer som påvirker translasjonen.

Fjerne restriksjonsenzym-snittpunkter : For å beskytte integriteten til genet.

Foretrukket codon: Optimalisering av donnorgen etter verten for å maksimere proteinettrykk.

Yaohai’s støtte

For genetisk design og syntese er bare proteinettrykk og codonoptimalisering ikke tilstrekkelig. Forskjellige metoder og programmer kan designe og produsere forskjellige codon-optimaliserte mRNA-sekvenser. Basert på ovennevnte optimaliseringsfaktorer, kombinert med sin egen offisielle database, og summerende flere års erfaring med genesyntese, har Yaohai Bio-Pharma utviklet sin unike codonoptimaliseringsdatabase. Den kan gi deg gratis codonoptimalisering og design av genesynteseskjema for å maksimere codonoptimaliseringen av din genesekvens.

Yaohai Bio-Pharma har etablert en fullstendig sett med teknologier for linear mRNA og sirkulær mRNA-syntese for å levere høykvalitets RNA, som omfatter sekvensdesign og optimalisering, genesyntese, IVT, sirkulering, RNA-rengjøring og LNP-kapsling.

Vi søker også aktivt globale partnere, både institusjonelle og enkeltpersoner. Vi tilbyr den mest konkurransedyktige kompensasjonen i bransjen. Hvis du har noen spørsmål, ikke nøl med å kontakte oss: [email protected]

For flere detaljer om Yaohai Bio-Pharma, vennligst se på vår nettside: www.yaohaibio-pharma.com