Codon-optimaliseringsstrategier

Det er 64 genetiske kodoner, hvorav 60 koder for 20 aminosyrer. Hver organisme som brukes til proteinuttrykk eller produksjon (inkludert Escherichia coli, gjær, pattedyrceller, Pichia, planteceller og insektceller) viser en viss grad av forskjell eller preferanse i kodonbruk. Kodoner som oftest brukes i en vert kalles optimale kodoner, mens de som ikke brukes ofte kalles sjeldne eller lavbrukskodoner.

Kodonoptimalisering

Kodonoptimalisering innebærer å modifisere en gensekvens ved å bruke foretrukne kodoner og unngå lav-bruk eller sjeldne kodoner, og deretter oppnå det modifiserte genet gjennom gensyntese. Denne redesignen av gener omtales som kodonoptimalisering.

En optimalisert gensekvens kan forbedre stabiliteten til den sekundære mRNA-strukturen, forhindre translasjonsforsinkelser, for tidlig translasjonsterminering, translasjonsrammeskifting og aminosyrefeil på grunn av utilstrekkelige tRNA-pooler.

Optimalisering er viktig fordi det letter effektiv progresjon av prosesser som gensyntese, vektorkonstruksjon, transkripsjon og translasjon.

Optimaliseringsfaktorer

Balansering av GC-innhold: Dette påvirker bindingsstabilitet, annealingstemperatur og proteinutbytte.

Redusere repeterende sekvenser: Dette reduserer vanskeligheten med gensyntese.

Justering av mRNA sekundær struktur: For å unngå hårnålsstrukturer som påvirker oversettelsen.

Eliminering av restriksjonsenzymkuttesteder: For å beskytte integriteten til genet.

Kodonpreferanse: Optimalisering av donorgenet i henhold til verten for å maksimere proteinuttrykk.

Yaohais støtte

For gendesign og -syntese er ikke bare proteinuttrykk og kodonoptimalisering tilstrekkelig. Ulike metoder og programmer kan designe og produsere forskjellige kodonoptimaliserte mRNA-sekvenser. Basert på de ovennevnte optimaliseringsfaktorene, kombinert med dens offisielle database, og oppsummering av mange års erfaring med gensyntese, har Yaohai Bio-Pharma utviklet sin unike kodonoptimaliseringsdatabase. Det kan gi deg gratis kodonoptimalisering og gensynteseskjemadesign for å maksimere kodonoptimaliseringen av gensekvensen din.

Yaohai Bio-Pharma har etablert et komplett sett med lineære mRNA- og sirkulære mRNA-synteseteknologier for å gi høykvalitets RNA, som sekvensdesign og optimalisering, gensyntese, IVT, sirkularisering, RNA-rensing og LNP-innkapsling.

Vi søker også aktivt etter institusjonelle eller individuelle globale partnere. Vi tilbyr den mest konkurransedyktige kompensasjonen i bransjen. Hvis du har spørsmål, kan du gjerne kontakte oss: [email protected]

For mer informasjon om Yaohai Bio-Pharma, vennligst se vår nettside: www.yaohaibio-pharma.com