Yaohai Bio-Pharma menyediakan circRNA berdasarkan sistem PIE (penjajaran ekson dan intron), yang bergantung kepada fungsi self-splicing intron jenis I untuk mencapai siklikan RNA. Struktur PIE direka menggunakan gen T4 td atau gen prekursor tRNA ikan, dan susunan adalah seperti berikut:
Intron RNA dan fragmen ekson sokongan dibahagikan kepada dua bahagian (hujung 5' dan hujung 3'), di mana urutan hujung 5' dipindahkan ke hujung belakang urutan sasaran, urutan hujung 3' disisipkan ke hadapan urutan sasaran, dan urutan gen sasaran disisipkan di tengah.
Di bawah katalisis GTP, struktur PIE membawa kepada siklikan urutan selain intron. Bergabung dengan strategi peningkatan kadar siklikan yang munasabah, Yaohai Bio-Pharma boleh mencapai siklikan urutan sehingga 4 kb dengan kadar siklikan lebih daripada 80%.
Rajah 1. Sirkulasi in vitro bagi circRNA berdasarkan pada sistem PIE
Proses | Perkhidmatan Pilihan | Butiran Perkhidmatan | Tempoh Penghantaran (hari kerja) |
reka bentuk dan optimasi urutan circRNA | Reka bentuk dan optimumkan urutan kod |
Penjajaran urutan CDS Pengoptimuman Kodon CDS |
1 |
Reka bentuk dan optimasi urutan tak bertindak |
Reka bentuk dan optimasi urutan intron dan ekson Reka bentuk dan optimasi urutan lengan homolog Reka bentuk dan optimasi urutan spacer |
1-2 |
Komponen CircRNA | Fungsi Biologi | Strategi pengoptimuman | |
Urutan intron dan ekson dua hujung | Pemautan diri intron yang dikedalikan GTP untuk pengikaran urutan di luar intron. | Direka mengikut gen T4 td atau gen precursor tRNA minyak ikan. | |
Pengekodan | IRES | Tapak pengenalan ribosom dalaman yang mengawal terjemahan circRNA. | Penapisan siri kawasan masuk ribosom dalaman (IRES) daripada sumber virus yang berbeza, contohnya EMCV, CVB3. |
CDS | Kawasan penyusunan protein, siri penyusun antigen, antibodi atau protein fungsional lain. | Pembaikan kodon meningkatkan tahap translasi; beberapa kodon bukan optimum mungkin memainkan peranan dalam pelipatan protein. | |
Tidak dikodkan | Siri tidak dikodkan | Menargetkan miRNA atau protein untuk melaksanakan pengaturan gen atau protein. | Menargetkan tapak ikatan spesifik untuk miRNA atau protein boleh mengulangi siri tapak ikatan tersebut. |
Yaohai Bio-Pharma melancarkan produk kawalan protein fluoresen hijau diperkuat (eGFP) circRNA, yang berdasarkan pada sistem PIE untuk mencapai siklikan RNA.
Dengan menggunakan bahan transfeksi konvensional, eGFP circRNA ditransfek ke dalam sel 293T, dan isyarat fluoresen eGFP (hijau) boleh dikesan selepas 24 jam, yang akan diperkuat selepas 48 jam. Isyarat fluoresen masih boleh dikesan pada hari ketujuh dan hari keempat belas selepas transfeksi.
Penilaian ungkapan in vitro bagi eGFP circRNA