Gen Terapisi Evrimi: Yeni DNA ve Optimizasyon Türkiye

DNA uygulamaları alanında, plazmit DNA (pDNA), olağanüstü kararlılığı, üretim, depolama ve taşıma kolaylığı nedeniyle her zaman oldukça tercih edilmiştir. Ancak, bilimsel araştırmalar ilerlemeye devam ettikçe, Minicircle DNA (mcDNA), Doggybone DNA (dbDNA) ve Close-Ended DNA (ceDNA) gibi bir dizi yeni DNA türü yavaş yavaş ortaya çıkmış ve gen terapisi ve diğer son teknoloji alanlar için yeni yollar açmıştır.

mcDNA

mcDNA, dairesel yapıyı korurken bakteriyel elementlerin çıkarıldığı ebeveyn plazmidlerinin rekombinasyon sürecinden türetilir. Hazırlanma süreci, φC31 integraz gibi belirli enzimatik aktivitelere dayanır ve daha yüksek rekombinasyon verimliliği elde edilir. mcDNA'nın dikkat çekici bir özelliği, bakteriyel dizilerin olmamasıdır, bu da küçük DNA taşıyıcılarına güvenmesine ve böylece gen ifadesini iyileştirmesine olanak tanır.

dbDNA

dbDNA, her iki ucunda küçük tek sarmallı halkalar bulunan kapalı çift sarmallı bir konformasyona sahiptir ve bakteri dizilerinden ve antibiyotik direnci genlerinden tamamen arındırılmıştır. Daha küçük boyutu, tam nükleaz direnci sergilerken hücrelere ve çekirdeklere daha kolay iletimi kolaylaştırır. dbDNA'nın ilk formu, gereksiz dizileri atlayarak yalnızca gen ifadesi için gerekli öğeleri içerir, böylece güçlü gen transfeksiyon yeteneklerine ve daha yüksek protein ifade seviyelerine sahiptir.

ceDNA

ceDNA, hedef geni ve diğer ifade düzenleyici öğeleri içeren, çift sarmallı, doğrusal, kovalent olarak kapalı uçlu bir DNA yapısıdır. Uçları, binlerce bazdan oluşan bir yapı kapasitesi sağlayan ters terminal tekrarlarıdır (ITR), geleneksel adeno-ilişkili virüs (AAV) vektörlerinin sınırlarını çok aşar. ceDNA'nın ITR yapısı çekirdeğe girmek için çok önemlidir ve ifade örüntüsü entegre olmayan epizomlarla tutarlıdır. Ek olarak, ceDNA'nın hazırlanma süreci hızlı ve uygun maliyetlidir, bu da onu nadir hastalıklar, aşılar ve onkoloji gibi alanlarda gen terapisi araştırmaları için uygun hale getirir.

DNA optimizasyonu

DNA optimizasyonu açısından araştırmacılar, plazmid DNA'sının içsel bileşenlerini optimize ederek transgenik genlerin ifadesini artırırlar. Aynı zamanda, otoimmün riskleri azaltmak için ampisilinin kanamisinle değiştirilmesi gibi seçilim belirteçleri değiştirilir. Dahası, sakaroz seçilim sistemi geleneksel seçilim belirteçlerinin yerini almak için de kullanılır. Kodon optimizasyonu açısından araştırmacılar, konakçının gen dizisi ifadesine yönelik tercihini tamamen göz önünde bulundurarak kodon kullanımını değiştirerek protein ifade düzeylerini iyileştirirler. Optimizasyon süreci sırasında araştırmacılar ayrıca kodon önyargısına, mRNA ikincil yapı kararlılığına, trans-etkili elementlerden ve restriksiyon enzimi bölgelerinden kaçınmaya ve GC içeriğinin dengesine dikkat etmelidir.

Özetle, yeni DNA tiplerinin geliştirilmesi ve DNA'nın optimizasyonu, gen terapisi gibi alanlar için yeni fırsatlar ve zorluklar sağlamıştır. Yaohai Bio-Pharma, hem dairesel hem de doğrusallaştırılmış plazmidler için GMP üretim platformları kurmuştur. Yaohai ayrıca, bu yeni DNA tipleri de dahil olmak üzere farklı DNA tiplerinin proses geliştirme ve optimizasyonunu sağlayarak müşterilerin farklı ihtiyaçlarını karşılayabilir.

Yaohai Bio-Pharma ayrıca aktif olarak kurumsal veya bireysel küresel ortaklar arıyor ve sektördeki en rekabetçi tazminatı sunuyor. Herhangi bir sorunuz varsa lütfen bizimle iletişime geçmekten çekinmeyin: [email protected]