코돈 최적화 전략

64개의 유전암호가 있으며, 이 중 60개가 20개의 아미노산을 인코딩합니다. 단백질 발현 또는 생산에 사용되는 모든 생물체(대장균(Escherichia coli), 효모, 포유류 세포, 피치아(Pichia), 식물 세포 및 곤충 세포 등)는 암호자 사용에서 어느 정도 차이 또는 선호도를 보입니다. 호스트에서 가장 자주 사용되는 암호자는 최적 암호자로 불리며, 자주 사용되지 않는 암호자는 희귀 또는 저사용 암호자라고 합니다.

암호자 최적화

암호자 최적화란 선호하는 암호자를 사용하고 저사용 또는 희귀 암호자를 피하여 유전자 서열을 수정한 후, 유전자 합성으로 수정된 유전자를 얻는 과정입니다. 이러한 유전자 재설계를 암호자 최적화라고 합니다.

최적화된 유전자 서열은 mRNA 2차 구조의 안정성을 높여 번역 지연, 조기 번역 종료, 번역 프레임 시프트 및 충분하지 않은 tRNA 풀로 인한 아미노산 불일치 등을 방지할 수 있습니다.

최적화는 유전자 합성, 벡터 구축, 전사, 번역과 같은 과정의 효율적인 진행을 촉진하기 때문에 중요합니다.

최적화 요인

GC 함량 균형 맞추기: 이것은 결합 안정성, 앤일링 온도 및 단백질 수율에 영향을 미칩니다.

반복 서열 줄이기: 이것은 유전자 합성의 어려움을 줄입니다.

MRNA 2차 구조 조절하기: 번역에 영향을 미치는 헤어핀 구조를 방지하기 위해.

제한 효소 절단 부위 제거 : 유전자의 무결성을 보호하기 위해.

코돈 선호도: 수용체에 따라 기증자 유전자를 최적화하여 단백질 발현을 최대화합니다.

야오해의 지원

유전자 설계 및 합성에서 단순히 단백질 발현과 코돈 최적화만으로는 충분하지 않습니다. 다양한 방법과 프로그램은 서로 다른 코돈 최적화된 mRNA 시퀀스를 설계하고 생산할 수 있습니다. 위의 최적화 요소들을 바탕으로 공식 데이터베이스와 다년간의 유전자 합성 경험을 종합하여 야오해 바이오-파마는 독특한 코돈 최적화 데이터베이스를 개발했습니다. 이는 귀하의 유전자 시퀀스의 코돈 최적화를 최대화하기 위한 무료 코돈 최적화 및 유전자 합성 방안 설계를 제공합니다.

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