코돈 최적화 전략

유전 코돈은 64개이며, 그 중 60개는 20개의 아미노산을 인코딩합니다. 단백질 발현이나 생산에 사용되는 모든 유기체(대장균, 효모, 포유류 세포, 피치아, 식물 세포, 곤충 세포 포함)는 코돈 사용에 어느 정도의 차이 또는 선호도를 보입니다. 숙주에서 가장 자주 사용되는 코돈을 최적 코돈이라고 하며, 자주 사용되지 않는 코돈을 희귀 코돈 또는 저사용 코돈이라고 합니다.

코돈 최적화

코돈 최적화는 선호하는 코돈을 활용하고 사용 빈도가 낮거나 희귀한 코돈을 피함으로써 유전자 서열을 수정한 다음, 유전자 합성을 통해 수정된 유전자를 얻는 것을 포함합니다. 이러한 유전자 재설계를 코돈 최적화라고 합니다.

최적화된 유전자 서열은 mRNA 2차 구조의 안정성을 향상시켜, 번역 지연, 조기 번역 종료, 번역 프레임시프팅, tRNA 풀 부족으로 인한 아미노산 불일치를 방지할 수 있습니다.

최적화는 유전자 합성, 벡터 구축, 전사, 번역 등의 과정의 효율적인 진행을 촉진하기 때문에 중요합니다.

최적화 요소

GC 콘텐츠 균형 조절: 이는 결합 안정성, 어닐링 온도 및 단백질 수율에 영향을 미칩니다.

반복되는 시퀀스 줄이기: 이렇게 하면 유전자 합성의 어려움이 줄어든다.

mRNA 2차 구조 조정: 번역에 영향을 미치는 헤어핀 구조를 피합니다.

제한효소 절단 부위 제거: 유전자의 무결성을 보호하기 위함.

코돈 선호도: 단백질 발현을 극대화하기 위해 숙주에 따라 공여 유전자를 최적화합니다.

야오하이의 지원

유전자 설계 및 합성의 경우, 단순한 단백질 발현과 코돈 최적화로는 충분하지 않습니다. 다양한 방법과 프로그램을 통해 다양한 코돈 최적화된 mRNA 시퀀스를 설계하고 생산할 수 있습니다. 위의 최적화 요인을 공식 데이터베이스와 결합하고 수년간의 유전자 합성 경험을 요약하여 Yaohai Bio-Pharma는 고유한 코돈 최적화 데이터베이스를 개발했습니다. 유전자 시퀀스의 코돈 최적화를 극대화하기 위해 무료 코돈 최적화 및 유전자 합성 계획 설계를 제공할 수 있습니다.

야오하이 바이오파마는 시퀀스 설계 및 최적화, 유전자 합성, IVT, 원형화, RNA 정제, LNP 캡슐화와 같은 고품질 RNA를 제공하기 위해 완전한 선형 mRNA 및 원형 mRNA 합성 기술을 구축했습니다.

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