Kodonien optimointistrategiat

On olemassa 64 geenikoodonia, joista 60 koodaa 20 aminohapua. Jokainen organismi, jota käytetään proteiinien ilmaisemiseen tai tuotantoon (mukaan lukien Escherichia coli, hiivat, nisäkäsolut, Pichia, kasvistulot ja hyönteisolut), näyttää eroavaisuuksia tai suosituksia koodin käytössä. Koodinit, jotka ovat yleisin käytössä isännössä, kutsutaan optimaalisiksi koodineiksi, kun taas harvoin käytetyt koodinit kutsutaan harvinaisiksi tai vähän käytetyiksi koodineiksi.

Koodin optimointi

Koodin optimointi sisältää geenijonon muuntamisen käyttämällä suosittuja koodineja ja välttämällä vähän käytettyjä tai harvinaisia koodineita, ja saamalla muunnettu geeni geenisynteesin avulla. Tämä geenien uudelleenmuokkaus tunnetaan nimellä koodin optimointi.

Optimoitu geenijono voi parantaa mRNA:n sekundärirakenteen vakautta, estämällä käännöksen viivytyksiä, ennenaikaista käännöksen loppumista, käännöksen kehyksen siirtymistä ja aminohapueroja, jotka johtuvat riittämättömistä tRNA-varastoista.

Optimointi on tärkeää, koska se helpottaa prosessien tehokasta edistymistä, kuten geenisynteesin, vektorirakennuksen, transkription ja käännettelyn.

Optimointitekijät

GC-sisällön tasapainottaminen: Tämä vaikuttaa sitoutumisen vakautta, annealointilämpötilaa ja proteiinin tuotantoon.

Toistuvien sekvenssien vähentäminen: Tämä vähentää geenisynteesin vaikeutta.

MRNA:n toissijaisrakenteen säätäminen: Välttääksesi hiustenkatkarakenteet, jotka vaikuttavat käännettelyyn.

Rajoitusensiimien leikkaussaitojen poistaminen : Suojataksesi geenin eheyden.

Koodon suosio: Mukauttaa antajageneetta mukaan ottamalla isäntä maksimoitaksesi proteiinin esityksen.

Yaohain tuki

Geenisuunnittelussa ja -synteesissä riittää ei pelkästään proteiiniesitys eikä koodonoptimaalinen prosessi. Erilaiset menetelmät ja ohjelmat voivat suunnitella ja tuottaa erilaisia koodonoptimoituja mRNA-sekvenssejä. Edellisten optimointitekijöiden perusteella, yhdistämällä virallisen tietokannan sekä vuosien geenisynteesi kokemusten yhteenveto, Yaohai Bio-Pharma on kehittänyt ainutlaatuisen koodonoptimaalisen tietokannan. Se voi tarjota sinulle ilmaista koodonoptimaalista suunnitelmaa ja geenisynteesi-skeemaa, jotta saat parhaan mahdollisen optimaalisuuden geneisekvenssistäsi.

Yaohai Bio-Pharma on perustanut täydellisen lineaarisen mRNA:n ja pyrkimyksellisen mRNA:n synteesiteknologian tarjotakseen korkealaatuisia RNA-molekyylejä, kuten sekvenssin suunnittelua ja optimointia, geenisynteesiä, IVT:tä, pyrkimystä, RNA-puhdistusta ja LNP-pakkauksen.

Hakemme myös aktiivisesti globaaleja kumppaneita instituutioilta tai yksilöiltä. Tarjoamme alan kilpailukykyisimmät palkkiot. Jos sinulla on kysymyksiä, ota meihin yhteyttä ilman epäröintiä: [email protected]

Lisätietoja Yaohai Bio-Pharma -yhtiöstä löydät verkkosivuilta: www.yaohaibio-pharma.com