Σύμφωνα με το κεντρικό δόγμα, το αγγελιοφόρο RNA (mRNA) είναι η γέφυρα για τη μετάδοση γενετικού υλικού από το DNA στις πρωτεΐνες.
Το mRNA παίζει βιολογικό ρόλο κωδικοποιώντας πρωτεΐνες in vivo και το ώριμο mRNA σε ευκαρυωτικούς οργανισμούς αποτελείται από πέντε συστατικά: 5' Cap (δομή καλύμματος), 5' UTR (μη κωδικοποιητική περιοχή), το ORF (ανοιχτό πλαίσιο ανάγνωσης), 3' UTR , και 3' ουρά πολυΑ (πολυαδενυλική ουρά).
Διαδικασία | Προαιρετική εξυπηρέτηση | Λεπτομέρειες υπηρεσιών | Περίοδος παράδοσης (Ημέρα) |
Σχεδιασμός και βελτιστοποίηση αλληλουχίας mRNA | Σχεδιασμός και βελτιστοποίηση ακολουθιών κωδικοποίησης |
Ευθυγράμμιση ακολουθίας CDS Βελτιστοποίηση κωδικονίων CDS |
1 |
Σχεδιασμός και βελτιστοποίηση μη κωδικοποιητικών ακολουθιών |
Σχεδιασμός και βελτιστοποίηση ακολουθίας 5' UTR Σχεδιασμός και βελτιστοποίηση ακολουθίας 3' UTR Σχεδιασμός και βελτιστοποίηση ακολουθίας polyA |
1-2 |
5' UTR/3' UTR |
|
3' PolyA Tail |
|
Συστατικά mRNA | Βιολογικές Λειτουργίες | Στρατηγικές Βελτιστοποίησης |
5' Καπ | Προστατέψτε το mRNA από αποικοδόμηση από εξωνουκλεάσες και ενεργήστε σε συνεννόηση με την ουρά πολυΑ στο 3' άκρο, την πρωτεΐνη δέσμευσης πολυΑ και την πρωτεΐνη παράγοντα έναρξης μετάφρασης για να ξεκινήσει η μετάφραση πρωτεΐνης. | The natural Cap1 structure avoids pattern recognition receptors and thus reduces the natural immune response, which can be achieved by one-step co-transcriptional capping or two-step enzymatic capping [see mRNA enzymatic capping and co-transcriptional capping for details]. |
5' UTR | Το 5' UTR μπορεί να αναγνωριστεί από τα ριβοσώματα, να ρυθμίσει τη μετάφραση του mRNA και να επηρεάσει τη σταθερότητα του mRNA. | Περιέχουν αλληλουχίες Kozak χωρίς πολύ σταθερή δευτερεύουσα δομή. Τα φυσικά UTR γονιδίων υψηλής έκφρασης προτιμώνται για τα mRNA μεταγραφής in vitro (IVT) όπως η α-σφαιρίνη και η β-σφαιρίνη. |
CDS | Περιοχές κωδικοποίησης πρωτεΐνης και κωδικοποιητικές αλληλουχίες για αντιγόνα, αντισώματα ή άλλες λειτουργικές πρωτεΐνες. | Η βελτιστοποίηση κωδικονίων αυξάνει το επίπεδο μετάφρασης, σημειώνοντας ότι ορισμένα μη βέλτιστα κωδικόνια μπορεί να παίζουν ρόλο στην αναδίπλωση των πρωτεϊνών. |
3' UTR | Ρυθμίζει τη μετάφραση και τη σταθερότητα του mRNA. | Τα φυσικά UTR γονιδίων υψηλής έκφρασης προτιμώνται για τα mRNA IVT όπως η α-σφαιρίνη και η β-σφαιρίνη. |
3' πολυΑ ουρά | Regulate protein expression and protect cap structure from degradation. | Απαιτείται επαρκές μήκος (100-150 bp). Η κωδικοποίηση της ουράς polyA στο πλασμίδιο του εκμαγείου μεταγραφής εξασφαλίζει ένα πιο καθορισμένο μήκος ουράς polyA. |
Πολλαπλές πηγές φυσικών και τροποποιημένων βιβλιοθηκών UTR με υψηλή έκφραση. ώριμη στρατηγική τροποποίησης UTR.
Συνεργαστείτε με μια επαγγελματική ομάδα αλγορίθμων AI για να ολοκληρώσετε τη βελτιστοποίηση των κωδικονίων.
Προσθέστε αλληλουχίες polyA σύμφωνα με πρότυπα DNA για να ελέγξετε το μήκος mRNA με μεγαλύτερη ακρίβεια.
Επίτευξη αποτελεσματικής έκφρασης mRNA με χαμηλή ανοσογονικότητα.
Σχεδιασμός αλληλουχίας mRNA διπλού αναφορέα: mRNA mCherry-eGFP
Η υπηρεσία mRNA της Yaohai Bio-Pharma συνεχίζει να αναβαθμίζεται με το σχεδιασμό και τη βελτιστοποίηση μιας διπλής αλληλουχίας γονιδίων αναφοράς, η οποία επιτυγχάνει συνέκφραση διπλών γονιδίων.
Χρησιμοποιώντας ένα συμβατικό αντιδραστήριο επιμόλυνσης, η διπλή αλληλουχία γονιδίου mCherry-eGFP mRNA διαμολύνεται σε κύτταρα 293Τ και δύο φθορίζοντα σήματα mCherry (κόκκινο) και ενισχυμένη πράσινη φθορίζουσα πρωτεΐνη (eGFP) ανιχνεύονται με ταυτόχρονη έκφραση μετά από 48 ώρες στοίβαξης, το γράφημα επισημαίνεται με κίτρινο χρώμα.
Έκφραση mRNA mCherry-eGFP σε κύτταρο 293Τ