লিকুইড ক্রোমাটোগ্রাফি-ম্যাস স্পেক্ট্রোমেট্রি (LC-MS) ভিত্তিক পিপটাইড ম্যাপিং ডেটা নেটিভ এবং রিকম্বিন্যান্ট প্রোটিনের প্রাথমিক এবং উচ্চতর গঠন সম্পর্কে বিশাল পরিমাণের তথ্য প্রদান করবে, যাতে অ্যামিনো এসিড সিকোয়েন্স কভারেজ, পোস্ট-ট্রান্সলেশনাল মডিফিকেশন (PTMs, যেমন গ্লাইকোসিলেশন, অক্সিডেশন, ডিঅ্যামিডেশন), ডিসালফাইড বন্ড ইত্যাদি অন্তর্ভুক্ত আছে।
যাওহাই বায়ো-ফার্মা আপনার লক্ষ্য প্রোটিনের জন্য LC-MS দ্বারা পিপটাইড ম্যাপিং বিশ্লেষণ সেবা প্রদান করে, যা আপনার প্রোটিন গঠন সম্পর্কে গবেষণা ত্বরান্বিত করবে।
আমরা বিভিন্ন বড় অণুর প্রোটিন গঠন চিত্রণে জড়িত ছিলাম, যাতে রিকম্বিন্যান্ট সাবইউনিট ভ্যাকসিন, ন্যানোবডিস/VHHs/ এক-ডোমেইন অ্যান্টিবডি (sdAbs), অ্যান্টিবডি ফ্র্যাগমেন্ট, হরমোন/পিপটাইড, সাইটোকাইন, গ্রোথ ফ্যাক্টর (GF), এনজাইম, কলাজেন ইত্যাদি অন্তর্ভুক্ত আছে।
পেপটাইড ম্যাপিং-এর জন্য নিয়ন্ত্রণমূলক আবশ্যকতা
ICHQ6B গাইডলাইন অনুসরণ করে, “পণ্যটিকে উপযুক্ত এনজাইম বা রাসায়নিক উপাদান ব্যবহার করে বিচ্ছিন্ন পেপটাইডগুলিতে ভেঙ্গে ফেলা হয় এবং ফলাফলস্বরূপ পেপটাইড টুকরোগুলি HPLC বা অন্য উপযুক্ত বিশ্লেষণ পদ্ধতি দ্বারা বিশ্লেষণ করা হয়। পেপটাইড টুকরোগুলি সম্ভবত সবচেয়ে বেশি পর্যন্ত পরিচিত করা হবে যেমন অ্যামিনো এসিড গঠন বিশ্লেষণ, N-শীর্ষ ক্রমবিন্যাস বা ম্যাস স্পেক্ট্রোমেট্রি (MS) এর মাধ্যমে। একটি উপযুক্তভাবে যাচাইকৃত পদ্ধতি ব্যবহার করে একটি সক্রিয় পদার্থ বা ওষুধ পণ্য (DP) এর পেপটাইড ম্যাপিং হল ব্যাচ মুক্তির জন্য প্রয়োজনীয় পণ্য গঠন নিশ্চিত করতে ব্যবহৃত একটি সাধারণ পদ্ধতি।”
বিশ্লেষণাত্মক পদ্ধতি
বিশ্লেষণ |
পদ্ধতি |
পিপটাইড ম্যাপিং |
প্রোটিয়াজ ডাইজেশন এবং তরল ক্রোমাটোগ্রাফি-ম্যাস স্পেক্ট্রোমেট্রি (LC-MS) |
বিশ্লেষণাত্মক প্রক্রিয়া
1. রিডাকশন এবং অ্যালকিলেশন
লক্ষ্য হল ডিসালফাইড ব্রিজ কমানো এবং উৎপন্ন মুক্ত থায়াইলকে ব্লক করা। ডিসালফাইড ব্রিজ কমানো প্রোটিন স্ট্রাকচার খোলার সাহায্য করে, যা প্রোটিনোলিটিক পাচনকে আরও দক্ষতার সাথে করে। এই ধাপে বহু-শেষানু প্রোটিনের কেসে শেষানুগুলির মধ্যে ডিসালফাইড ব্রিজ (যেমন: মনোক্লোনাল অ্যান্টিবডি, mAbs) লিঙ্ক করা হয়।
২. এনজাইম ব্যবহার করে প্রোটিনের পাচন
লক্ষ্য হল প্রোটিনকে পিপটাইডে ভেঙ্গে ফেলা। আমরা প্রোটিনের তাত্ত্বিক ক্রম এবং এনজাইম দ্বারা প্রোটিনের তাত্ত্বিক পাচনের জ্ঞানের উপর ভিত্তি করে এনজাইম নির্বাচন করি। এইভাবে এনজাইম নির্বাচন করলে শ্রেষ্ঠ পিপটাইড ম্যাপিং বিশ্লেষণ ফলে উঠবে।
৩. পাচন করা পিপটাইডের বিশ্লেষণ অনলাইন রিভার্স ফেজ-উচ্চ পারফরম্যান্স তরল ক্রোমাটোগ্রাফি ব্যবহার করে আলোকপরিমাপী (UV) এবং ইলেকট্রোস্প্রে-ম্যাস স্পেক্ট্রোমেট্রিক ডিটেকশন (LC/ES-MS)।
LC (রিভার্স ফেজ-LC) ব্যবহার করে পোলারিটি ভিত্তিতে পিপটাইড বিয়োজন
পেপটাইড এলসি কলাম থেকে বিলুপ্ত হওয়ার সময়, ম্যাস স্পেক্ট্রোমিটার ম্যাস তথ্য এবং ভগ্নাংশ আয়ন তথ্য উত্পাদন করবে, যা আমাদের সিকোয়েন্স তথ্য নির্ধারণ করতে সাহায্য করে। আমরা সিকোয়েন্স তথ্য ব্যবহার করে পেপটাইড পরিচয় নিশ্চিত করি এবং প্রাথমিক তথ্য প্রদান করি।
আমরা এলসি কলাম থেকে ম্যাস স্পেক্ট্রোমিটার সোর্সে পেপটাইড প্রবেশ করার সময়ও ভগ্নাংশ তথ্য উত্পাদন করতে পারি। অধ্যয়নের প্রয়োজন অনুযায়ী, এটি বাছাইকৃত এলসি-এমএস/এমএস বা বাছাইকৃত নয়, যা এক ধরনের ট্যান্ডেম এমএস হিসেবে বিবেচনা করা যেতে পারে।