লিকুইড ক্রোমাটোগ্রাফি-ম্যাস স্পেকট্রোমেট্রি (এলসি-এমএস) ভিত্তিক পেপটাইড ম্যাপিং ডেটা অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স কভারেজ, পোস্ট-ট্রান্সলেশনাল পরিবর্তন (পিটিএম, যেমন, গ্লাইকোসিলেশন) সহ নেটিভ এবং রিকম্বিন্যান্ট প্রোটিনের প্রাথমিক এবং উচ্চ ক্রম কাঠামোর উপর প্রচুর পরিমাণে তথ্য সরবরাহ করবে। , অক্সিডেশন, ডেমিডেশন), ডিসালফাইড বন্ড ইত্যাদি।
ইয়াওহাই বায়ো-ফার্মা LC-MS দ্বারা আপনার লক্ষ্য প্রোটিনের জন্য পেপটাইড ম্যাপিং বিশ্লেষণ পরিষেবা অফার করে, প্রোটিন গঠনের উপর আপনার গবেষণার গতি বাড়ানোর জন্য।
আমরা রিকম্বিন্যান্ট সাবুনিট ভ্যাকসিন, ন্যানোবডি/ভিএইচএইচ/ একক-ডোমেন অ্যান্টিবডি (এসডিএবিএস), অ্যান্টিবডি ফ্র্যাগমেন্টস, হরমোন/পেপটাইডস, সাইটোকাইনস, গ্রোথ ফ্যাক্টর (জিএফ), এনজাইম, কোলাজ সহ বিভিন্ন বৃহৎ অণুর প্রোটিন স্ট্রাকচারাল ক্যারেক্টারাইজেশনের সাথে জড়িত। ইত্যাদি
পেপটাইড ম্যাপিংয়ের জন্য নিয়ন্ত্রক প্রয়োজনীয়তা
ICHQ6B নির্দেশিকা সুপারিশ করে, “উপযুক্ত এনজাইম বা রাসায়নিক ব্যবহার করে পণ্যের বিচ্ছিন্ন পেপটাইডে নির্বাচনী বিভক্তকরণ করা হয় এবং ফলস্বরূপ পেপটাইড খণ্ডগুলি HPLC বা অন্যান্য উপযুক্ত বিশ্লেষণী পদ্ধতি দ্বারা বিশ্লেষণ করা হয়। অ্যামিনো অ্যাসিড রচনা বিশ্লেষণ, এন-টার্মিনাল সিকোয়েন্সিং বা ভর স্পেকট্রোমেট্রি (এমএস) এর মতো কৌশলগুলি ব্যবহার করে যতদূর সম্ভব পেপটাইডের টুকরো চিহ্নিত করা উচিত। একটি যথাযথভাবে বৈধ পদ্ধতি ব্যবহার করে সক্রিয় পদার্থ বা ড্রাগ পণ্যের (DP) পেপটাইড ম্যাপিং একটি পদ্ধতি যা প্রায়শই ব্যাচ প্রকাশের জন্য পছন্দসই পণ্যের কাঠামো নিশ্চিত করতে ব্যবহৃত হয়।"
বিশ্লেষণাত্মক পদ্ধতি
বিশ্লেষণ |
পদ্ধতি |
পেপটাইড ম্যাপিং |
প্রোটিজ হজম এবং তরল ক্রোমাটোগ্রাফি-ম্যাস স্পেকট্রোমেট্রি (এলসি-এমএস) |
বিশ্লেষণ পদ্ধতি
1. হ্রাস এবং অ্যালকিলেশন
উদ্দেশ্য হল ডিসালফাইড ব্রিজ কমানো এবং উৎপন্ন ফ্রি থিওল ব্লক করা। ডিসালফাইড ব্রিজ হ্রাস প্রোটিন কাঠামো খুলতে সাহায্য করে যা প্রোটিওলাইটিক হজমকে আরও দক্ষ করে তোলে। এই পদক্ষেপটি মাল্টি-চেইন প্রোটিনের ক্ষেত্রে চেইনগুলির মধ্যে ব্রিজগুলিকেও ভেঙ্গে ফেলবে যেখানে চেইনগুলির সাথে সংযোগকারী ডিসালফাইড সেতু রয়েছে (যেমন মনোক্লোনাল অ্যান্টিবডি,mAbs)।
2. এনজাইম ব্যবহার করে প্রোটিনের পরিপাক
উদ্দেশ্য হল প্রোটিনকে ভেঙ্গে পেপটাইডে পরিণত করা। আমরা প্রোটিনের তাত্ত্বিক ক্রম এবং এনজাইম দ্বারা প্রোটিনের তাত্ত্বিক হজমের জ্ঞানের উপর ভিত্তি করে এনজাইমগুলি বেছে নিয়েছি। এইভাবে এনজাইম নির্বাচন করা, সেরা পেপটাইড ম্যাপিং বিশ্লেষণের ফলাফল হওয়া উচিত।
3. পরিপাক পেপটাইডের বিশ্লেষণ আল্ট্রাভায়োলেট (UV) এবং ইলেক্ট্রোস্প্রে-ম্যাস স্পেকট্রোমেট্রিক ডিটেকশন (LC/ES-MS) সহ অন-লাইন রিভার্স ফেজ-হাই পারফরম্যান্স লিকুইড ক্রোমাটোগ্রাফি ব্যবহার করা।
LC ব্যবহার করে পোলারিটির উপর ভিত্তি করে পেপটাইড বিচ্ছেদ (রিভার্স ফেজ-এলসি)
এলসি কলাম থেকে পেপটাইড নির্গত হওয়ার সাথে সাথে, ভর স্পেকট্রোমিটার টুকরো আয়ন তথ্যের সাথে ভর তথ্য তৈরি করবে, যা আমাদের ক্রম তথ্য নির্ধারণ করতে দেয়। আমরা পেপটাইড পরিচয় নিশ্চিত করতে এবং প্রাথমিক তথ্য প্রদান করতে ক্রম তথ্য ব্যবহার করি।
এলসি কলাম থেকে ভর স্পেকট্রোমিটার উত্সে প্রবেশ করার সাথে সাথে আমরা পেপটাইডগুলি থেকে বিভক্তকরণ তথ্যও তৈরি করতে পারি। অধ্যয়নের প্রয়োজনীয়তার উপর নির্ভর করে, এটি হয় নির্বাচনী এলসি-এমএস/এমএস বা অ-নির্বাচিত, যাকে ট্যান্ডেম এমএসের একটি রূপ হিসাবে বিবেচনা করা যেতে পারে।