Sve kategorije
ENEN
dizajn sekvence circRNA

dizajn sekvence circRNA

Početna strana >  IVT RNA  >  Prilagođena sinteza RNA  >  Prilagođena sinteza circRNA  >  dizajn sekvence circRNA

IVT RNA

dizajn sekvence circRNA

Yaohai Bio-Pharma priprema circRNA na osnovu PIE sistema (poravnanja eksona i introna), što zavisi od samospajajuće funkcije tipa I introna da bi se postigla ciklizacija RNA. PIE struktura je dizajnirana pomoću T4 td gene ili prekurzora ribne tRNA gene, a raspored je sledeći:

RNA intron i podržavajući eksonski odlomak su podeljeni na dva dela (5' terminalni i 3' terminalni), gde se 5' terminalni niz prenosi na rep ciljnog niza, 3' terminalni niz se umetanja ispred ciljnog niza, a ciljni genetski niz se umetanja u sredinu.

undefined

Pod katalizom GTP, PIE struktura vodi do ciklizacije nizova osim introna. U kombinaciji sa razumljivom strategijom poboljšanja stopa ciklizacije, Yaohai Bio-Pharma može da postigne ciklizaciju nizova dužine do 4 kb sa stopom ciklizacije većom od 80%.

undefined

Slika 1. In vitro cirkulacija circRNA bazirana na sistemu PIE

Detalji usluga
Процес Opcionalna Usluga Detalji usluge Rok isporuke (radni dan)
dizajn i optimizacija sekvence circRNA Dizajn i optimizacija kodirajućih sekvenci

Poravnanje CDS sekvence

Optimizacija kodona CDS

1
Dizajn i optimizacija ne-kodirajućih nizova

Dizajn i optimizacija intronskih i ekstronskih nizova

Dizajn i optimizacija homoloških ramova

Dizajn i optimizacija sekvenci za razmak

1-2
Uobičajene strategije za dizajn mRNA sekvence
Komponente CircRNA Biološke funkcije Strategije optimizacije
Sekvence sa dva kraja introna i ekzona GTP-katalizovano samospajanje introna za ciklizaciju sekvenci izvan introna. Dizajnirano prema genu T4 td ili prekursoru gena tRNA ribiće ulje.
Kodiranje IRES Unutrašnje mesto prepoznavanja ribozoma koje reguliše prevod circRNA. Testiranje sekvenci unutarnjeg sajta ulaska ribozoma (IRES) iz različitih virusnih izvora, npr. EMCV, CVB3 izvori.
CDS Regioni koji kodiraju proteine, sekvence koje kodiraju antigene, antitela ili druge funkcionalne proteine. Optimizacija kodona povećava nivo translacije; neki neoptimalni kodoni mogu imati ulogu u savijanju proteina.
Nekodirajući Nekodirajuće sekvence Ciljanje miRNA-ova ili proteina da bi se izvršila regulacija gene ili proteina. Ciljanje specifičnih vezivnih lokacija za miRNA-ove ili proteine može ponavljati sekvence vezivnog lokacije.
Naše karakteristike
  • Optimizovani PIE Sistem Ciklizacije kombinovan sa razumnim strategijama optimizacije da bi se postigla stopa ciklizacije veća od 80%;
  • Suradnja s vodećim timom za Optimizaciju CDS-a uz profesionalni AI algoritamski tim za dovršavanje optimizacije kodona u regionu CDS;
  • Dovršeni i savršen proces circRNA može se postići sa visokom efikasnošću cikliranja, visokom stabilnosti i visokom efikasnošću prevoda.
Studija slučaja

Yaohai Bio-Pharma je lansirao kontrolni proizvod pojačan zeleni fluorescentski protein (eGFP) circRNA, koji se bazira na PIE sistemu da bi se postiglo cikliranje RNA.

Korišćenjem konvencionalnog reagenta za transfekciju, eGFP circRNA se transfekuje u 293T celije, a eGFP (zeleno) fluorescentski signal može biti detektovan nakon 24h, što će biti pojačano nakon 48h. Florescentski signal još uvek može biti detektovan na sedmi dan i četrnaesti dan nakon transfekcije.

图片

Validacija izražavanja in vitro za eGFP circRNA

Dobijte besplatnu ponudu

Get in touch