Strategier för kodonoptimering

Det finns 64 genetiska kodoner, varav 60 kodar för 20 aminosyror. Varje organism som används för proteinetablering eller produktion (inklusive Escherichia coli, jäszytor, djurceller, Pichia, växtd celler och insektsceller) visar en viss grad av skillnad eller preferens i kodonanvändning. De kodoner som används oftast i en värd kallas optimala kodoner, medan de som sällan används kallas sällsynta eller lågfrekventa kodoner.

Kodonoptimering

Kodonoptimering innebär att modifiera en genesekvens genom att använda föredragna kodoner och undvika lågfrekventa eller sällsynta kodoner, och sedan erhålla den modifierade genen genom genesyntes. Denna om design av gener kallas för kodonoptimering.

En optimerad genesekvens kan förbättra stabiliteten hos mRNA:s sekundärstruktur, vilket förhindrar översättningstillfällen, tidiga avslutningar av översättning, ramförskjutningar vid översättning och aminosyramatchningar på grund av otillräckliga tRNA-pooler.

Optimering är viktig eftersom den möjliggör en effektiv framsteg av processer som genesyntes, vektorbygge, transkription och translation.

Optimeringsfaktorer

Att balansera GC-innehåll: Detta påverkar bindningsstabilitet, anneklingstemperatur och proteinyield.

Att minska upprepningssekvenser: Detta minskar svårigheten med genesyntes.

Att justera mRNA:s sekundärstruktur: För att undvika hårpinstrukture som påverkar translationen.

Att eliminera restriktionsensymbitssidor : För att skydda integriteten hos genen.

Kodonpreferens: Optimera donnargenen enligt värdorganismen för att maximera proteinetablering.

Yaohais stöd

För gendesign och -syntes räcker det inte med endast proteinetablering och kodonoptimering. Olika metoder och program kan designa och producera olika kodonoptimerade mRNA-sekvenser. Utifrån ovanstående optimeringsfaktorer, kombinerat med dess officiella databas och sammanfattningsvis flera års erfarenhet av gensyntes, har Yaohai Bio-Pharma utvecklat sin unika kodonoptimeringsdatabas. Den kan erbjuda dig kostnadsfri kodonoptimering och genvårdsschema för att maximera kodonoptimeringen av din gensekvens.

Yaohai Bio-Pharma har etablerat en komplett uppsättning tekniker för linjär mRNA och cirkulär mRNA-syntes för att erbjuda högkvalitativ RNA, såsom sekvensdesign och optimering, gensyntes, IVT, cirkularisering, RNArensningsprocess och LNP inkapsling.

Vi söker också aktivt globala partnerschaft med institutioner eller enskilda personer. Vi erbjuder den mest konkurrenskraftiga ersättningen inom branschen. Om du har några frågor, tveka inte att kontakta oss: [email protected]

För mer information om Yaohai Bio-Pharma, vänligen besök vår webbplats: www.yaohaibio-pharma.com