Kodonoptimeringsstrategier

Det finns 64 genetiska kodon, varav 60 kodar för 20 aminosyror. Varje organism som används för proteinuttryck eller produktion (inklusive Escherichia coli, jäst, däggdjursceller, Pichia, växtceller och insektsceller) uppvisar en viss grad av skillnad eller preferens i kodonanvändning. Kodon som oftast används i en värd kallas optimala kodon, medan de som inte används ofta kallas sällsynta kodon eller kodon med låg användning.

Kodonoptimering

Kodonoptimering innebär att modifiera en gensekvens genom att använda föredragna kodon och undvika låganvändning eller sällsynta kodon, och sedan erhålla den modifierade genen genom gensyntes. Denna omdesign av gener kallas kodonoptimering.

En optimerad gensekvens kan förbättra stabiliteten hos den sekundära mRNA-strukturen, förhindra translationsfördröjningar, för tidig translationsterminering, translationell ramförskjutning och aminosyrafelparningar på grund av otillräckliga tRNA-pooler.

Optimering är betydande eftersom det underlättar effektiv progression av processer såsom gensyntes, vektorkonstruktion, transkription och translation.

Optimeringsfaktorer

Balansering av GC-innehåll: Detta påverkar bindningsstabilitet, hybridiseringstemperatur och proteinutbyte.

Minska repetitiva sekvenser: Detta minskar svårigheten med gensyntes.

Justera mRNA sekundär struktur: För att undvika hårnålsstrukturer som påverkar översättningen.

Eliminering av restriktionsenzymskärningsställen: För att skydda genens integritet.

Kodon-preferens: Optimering av donatorgenen enligt värden för att maximera proteinuttryck.

Yaohais stöd

För gendesign och syntes räcker inte bara proteinuttryck och kodonoptimering. Olika metoder och program kan designa och producera olika kodonoptimerade mRNA-sekvenser. Baserat på ovanstående optimeringsfaktorer, kombinerat med dess officiella databas, och en sammanfattning av flera års erfarenhet av gensyntes, har Yaohai Bio-Pharma utvecklat sin unika kodonoptimeringsdatabas. Det kan ge dig gratis kodonoptimering och design av gensyntesschema för att maximera kodonoptimeringen av din gensekvens.

Yaohai Bio-Pharma har etablerat en komplett uppsättning linjära mRNA- och cirkulära mRNA-syntesteknologier för att tillhandahålla högkvalitativt RNA, såsom sekvensdesign och optimering, gensyntes, IVT, cirkularisering, RNA-rening och LNP-inkapsling.

Vi söker också aktivt institutionella eller individuella globala partners. Vi erbjuder den mest konkurrenskraftiga ersättningen i branschen. Om du har några frågor är du välkommen att kontakta oss: [email protected]

För mer information om Yaohai Bio-Pharma, vänligen se vår hemsida: www.yaohaibio-pharma.com