Strategii de optimizare a codonilor

Există 64 de codoni genetici, dintre care 60 codifică 20 de aminoacizi. Fiecare organism utilizat pentru exprimarea sau producerea proteinelor (inclusiv Escherichia coli, drojdie, celule de mamifere, Pichia, celule de plante și celule de insecte) prezintă un anumit grad de diferență sau preferință în utilizarea codonilor. Codonii utilizați cel mai frecvent într-o gazdă sunt numiți codoni optimi, în timp ce cei care nu sunt utilizați frecvent sunt numiți codoni rari sau cu utilizare redusă.

Optimizarea codonilor

Optimizarea codonilor implică modificarea unei secvențe de genă prin utilizarea codonilor preferați și evitarea codonilor rari sau cu utilizare redusă și apoi obținerea genei modificate prin sinteza genei. Această reproiectare a genelor este denumită optimizare a codonilor.

O secvență de genă optimizată poate îmbunătăți stabilitatea structurii secundare a ARNm, prevenind întârzierile de traducere, terminarea prematură a traducerii, schimbarea cadrelor de translație și nepotrivirile de aminoacizi din cauza pool-urilor insuficiente de ARNt.

Optimizarea este semnificativă deoarece facilitează progresia eficientă a proceselor cum ar fi sinteza genelor, construcția vectorului, transcripția și traducerea.

Factori de optimizare

Echilibrarea conținutului GC: Acest lucru afectează stabilitatea de legare, temperatura de recoacere și randamentul de proteine.

Reducerea secvențelor repetitive: Acest lucru scade dificultatea sintezei genelor.

Ajustarea structurii secundare ARNm: Pentru a evita structurile ac de păr care afectează translația.

Eliminarea locurilor de tăiere a enzimelor de restricție: Pentru a proteja integritatea genei.

Preferința codonului: Optimizarea genei donor în funcție de gazdă pentru a maximiza expresia proteinei.

Sprijinul lui Yaohai

Pentru proiectarea și sinteza genelor, simpla exprimare a proteinei și optimizarea codonilor nu sunt suficiente. Diferite metode și programe pot proiecta și produce diferite secvențe de ARNm optimizate pentru codoni. Pe baza factorilor de optimizare de mai sus, combinați cu baza sa de date oficială și rezumand ani de experiență în sinteza genelor, Yaohai Bio-Pharma și-a dezvoltat baza de date unică de optimizare a codonilor. Vă poate oferi optimizarea gratuită a codonilor și proiectarea schemei de sinteză a genelor pentru a maximiza optimizarea codonilor secvenței dvs. de gene.

Yaohai Bio-Pharma a stabilit un set complet de tehnologii de sinteză ARNm liniară și circulară pentru a oferi ARN de înaltă calitate, cum ar fi proiectarea și optimizarea secvenței, sinteza genelor, IVT, circularizarea, purificarea ARN și încapsularea LNP.

De asemenea, căutăm în mod activ parteneri instituționali sau individuali la nivel mondial. Oferim cea mai competitivă compensație din industrie. Dacă aveți întrebări, vă rugăm să nu ezitați să ne contactați: [email protected]

Pentru mai multe detalii despre Yaohai Bio-Pharma, vă rugăm să consultați site-ul nostru: www.yaohaibio-pharma.com