Strategii de optimizare a codonilor

Există 64 codoni genetici, dintre care 60 codifică 20 de acizi amino. Orice organism folosit pentru expresia sau producerea de proteine (inclusiv Escherichia coli, levurile, celulele mamiferiene, Pichia, celulele vegetale și celulele insectelor) prezintă un anumit grad de diferență sau preferință în ceea ce privește utilizarea codonilor. Codonii folosiți cu frecvență într-un gazdă sunt denumiți codoni optimași, în timp ce cei puțin folosiți sunt denumiți codoni rari sau cu uz minim.

Optimizare a codonilor

Optimizarea codonilor implică modificarea unei secvențe gene prin utilizarea codonilor preferați și evitarea celor cu uz scăzut sau rari, iar apoi obținerea genului modificat prin sinteză genetică. Această redeschidere a genelor este denumită optimizare a codonilor.

O secvență genetică optimizată poate îmbunătăți stabilitatea structurii secondare a mRNA-ului, prevenind întârzierile în traducere, terminarea prematură a traducerii, derularea cadrului de traducere și incompatibilitățile de acizi amino din cauza lipsei de tRNA suficiente.

Optimizarea este importantă deoarece facilitează progresul eficient al proceselor precum sinteza genelor, construcția vectorilor, transcripția și traducerea.

Factori de Optimizare

Echilibrarea conținutului GC: Acest lucru influențează stabilitatea legăturii, temperatura de anealare și cantitatea de proteină produsă.

Reducerea secvențelor repetitive: Acest lucru scade dificultatea sintezei genelor.

Ajustarea structurii secondare a mRNA-ului: Pentru a evita structurile de tip hairpin care afectează traducerea.

Eliminarea punctelor de taieră a enzimelor de restricție : Pentru a proteja integritatea genului.

Preferință de codon: Optimizarea genului donator conform gazdei pentru a maximiza expresia proteinului.

Suportul Yaohai

Pentru designul și sinteza genetică, expresia proteinului și optimizarea codonului nu sunt suficiente. Metode și programe diferite pot să conceapă și producă secvențe mRNA cu codon optimizat diferit. Pe baza factorilor de optimizare menționați mai sus, combinându-se cu baza de date oficială și rezumatul experienței de ani în sinteza genetică, Yaohai Bio-Pharma a dezvoltat baza sa de date unică de optimizare a codonului. Aceasta poate să vă ofere optimizare gratuită a codonului și design al schemei de sinteză genetică pentru a maximiza optimizarea codonului secvenței dvs. genetice.

Yaohai Bio-Pharma a stabilit un set complet de tehnologii de sinteză a mRNA liniar și circular pentru a oferi RNA de înaltă calitate, cum ar fi designul și optimizarea secvențelor, sinteza genetică, IVT, circularizarea, purificarea RNA și incapsularea LNP.

Cautăm activ parteneri instituționali sau individuali la nivel global. Ofertăm cea mai competitivă compensație din industrie. Dacă aveți întrebări, nu ezitați să ne contactați: [email protected]

Pentru mai multe detalii despre Yaohai Bio-Pharma, vă rugăm să consultați site-ul nostru web: www.yaohaibio-pharma.com