কেন্দ্রীয় ডগমা অনুযায়ী, মেসেঞ্জার RNA (mRNA) হল জিনেটিক উপাদানের DNA থেকে প্রোটিনে পরিবর্তনের জন্য সেতু।
একটি জীবনে প্রোটিনকে এনকোড করা mRNA একটি জৈব ভূমিকা পালন করে, এবং ইউক্যারিয়টিক জীবে পরিপক্ক mRNA পাঁচটি উপাদান দ্বারা গঠিত: 5' Cap (ক্যাপ স্ট্রাকচার), 5' UTR (কোডিং নয় অঞ্চল), ORF (ওপেন রিডিং ফ্রেম), 3' UTR, এবং 3' polyA টেইল (পলিঅ্যাডেনাইলেট টেইল)।
প্রক্রিয়া | পছন্দসই সেবা | সেবা বিবরণ | ডেলিভারি পিরিয়ড (ডে) |
mRNA সিকোয়েন্স ডিজাইন এবং অপটিমাইজেশন | কোডিং সিকোয়েন্সের ডিজাইন এবং অপটিমাইজেশন |
CDS সিকোয়েন্স এলাইনমেন্ট CDS কোডন অপটিমাইজেশন |
1 |
নন-কোডিং সিকোয়েন্সের ডিজাইন এবং অপটিমাইজেশন |
5' UTR সিকোয়েন্স ডিজাইন এবং অপটিমাইজেশন 3' UTR সিকোয়েন্স ডিজাইন এবং অপটিমাইজেশন polyA সিকোয়েন্স ডিজাইন এবং অপটিমাইজেশন |
১-২ |
5’ UTR/3’ UTR |
|
3' পলিA টেইল |
|
mRNA উপাদান | জৈবিক কার্যাবলি | অপ্টিমাইজেশন কৌশলগুলি |
৫’ ক্যাপ | এক্সোনিউক্লেজ দ্বারা mRNA-র বিক্ষেপণ থেকে রক্ষা প্রদান করুন এবং 3' অন্ত্য প্রান্তের polyA টেল এবং polyA বাইন্ডিং প্রোটিন এবং অনুবাদ আরম্ভ ফ্যাক্টর প্রোটিনের সাথে একত্রে কাজ করুন যাতে প্রোটিন অনুবাদ শুরু হয়। | আসল Cap1 স্ট্রাকচার প্যাটার্ন রেকগনিশন রিসেপ্টর এড়িয়ে চলে এবং তাই স্বাভাবিক অভিমান প্রতিক্রিয়া হ্রাস করে, যা এক-ধাপের কো-ট্রান্সক্রিপশনাল ক্যাপিং বা দুই-ধাপের এনজাইমেটিক ক্যাপিং দ্বারা সম্পন্ন করা যেতে পারে [বিস্তারিত জানতে mRNA এনজাইমেটিক ক্যাপিং এবং কো-ট্রান্সক্রিপশনাল ক্যাপিং দেখুন]। |
5' UTR | 5' UTR কে রাইবোসোম চিহ্নিত করতে পারে, mRNA অনুবাদকে নিয়ন্ত্রণ করতে পারে এবং mRNA-র স্থিতিশীলতা প্রভাবিত করতে পারে। | অত্যন্ত স্থিতিশীল দ্বিতীয়ার স্ট্রাকচার ছাড়াই Kozak সিকোয়েন্স অন্তর্ভুক্ত করুন। IVT mRNA-র জন্য উচ্চ পরিমাণে অভিব্যক্ত জিনের স্বাভাবিক UTR-গুলি পছন্দ করা হয়, যেমন α-গ্লোবিন এবং β-গ্লোবিন। |
CDS | প্রোটিন-কোডিং অঞ্চল এবং এন্টিজেন, এন্টিবডি বা অন্যান্য কার্যকর প্রোটিনের জন্য কোডিং সিকোয়েন্স। | কোডন অপটিমাইজেশন অনুবাদের স্তর বাড়ায়, লক্ষ্য রাখা উচিত যে কিছু অ-অপটিমাল কোডন প্রোটিন ফোল্ডিং-এ ভূমিকা রাখতে পারে। |
৩' UTR | MRNA অনুবাদ এবং স্থিতিশীলতা নিয়ন্ত্রণ করে। | উচ্চভাবে প্রকাশিত জিনের প্রাকৃতিক UTRs পছন্দ করা হয় IVT mRNA-এর জন্য, যেমন α-গ্লোবিন এবং β-গ্লোবিন। |
৩' polyA টেইল | প্রোটিন প্রকাশ নিয়ন্ত্রণ করে এবং ক্যাপ স্ট্রাকচারকে বিঘ্ন থেকে রক্ষা করে। | অনুগত দৈর্ঘ্য (১০০-১৫০ bp) প্রয়োজন; ট্রান্সক্রিপশন টেমপ্লেট প্লাজমিডে polyA টেইল এনকোডিং করা আরও সংজ্ঞায়িত polyA টেইল দৈর্ঘ্য নিশ্চিত করে। |
উচ্চভাবে প্রকাশিত প্রাকৃতিক এবং পরিবর্তিত UTR লাইব্রেরির বহুমুখী উৎস; পরিপক্ক UTR পরিবর্তন পদ্ধতি;
একটি পেশাদার আই আই অ্যালগোরিদম দলের সাথে সহযোগিতা করে কোডন অপটিমাইজেশন সম্পূর্ণ করুন।
ডিএনএ টেমপ্লেটের উপর ভিত্তি করে পলিএ সিকোয়েন্স যোগ করুন যাতে এমআরএনএর দৈর্ঘ্যকে আরও সঠিকভাবে নিয়ন্ত্রণ করা যায়।
নিম্ন ইমিউনোজেনিসিটি সহ এমআরএনএর দক্ষ অভিব্যক্তি অর্জন করুন।
ডুয়াল-রিপোর্টার এমআরএনএর সিকোয়েন্স ডিজাইন: mCherry-eGFP এমআরএনএ
যাওহাই বায়ো-ফার্মার এমআরএনএ সার্ভিস ডাবল রিপোর্টার জিন ট্যান্ডেম সিকোয়েন্সের ডিজাইন এবং অপটিমাইজেশনের সাথে অধিকতর আপডেট হচ্ছে, যা ডুয়াল জিনের সহ-অভিব্যক্তি অর্জন করে।
একটি সাধারণ ট্রান্সফেকশন রিজেন্ট ব্যবহার করে, ডাবল জিন ট্যান্ডেম সিকুয়েন্স mCherry-eGFP এমআরএনএকে 293T কোষে ট্রান্সফেক্ট করা হয়, এবং 48 ঘন্টা পর দুটি ফ্লোরেসেন্ট সিগন্যাল ম্যাচ করা হয় mCherry (লাল) এবং এনহ্যান্সড গ্রীন ফ্লোরেসেন্ট প্রোটিন (eGFP) এর সাথে একই সময়ে অভিব্যক্তি হয় এবং স্ট্যাকড গ্রাফ হলুদ রঙে উল্লেখযোগ্য।
MCherry-eGFP এমআরএনএ 293T কোষে অভিব্যক্তি