N-glycosylation سائٹ اشغال glycoproteins کی ایک فزیولوژیکل خصوصیت ہے اور مخصوص طور پر N-glycan پیدا کرتا ہے۔ Yaohai Bio-Pharma کی N-glycosylation سائٹ اشغال تجزیہ خدمات لیکوڈ کروموگرافی-الیکٹروسپری آئونائزیشن میس سپیکٹرومیٹری (LC-ESI-MS/MS) کے ذریعہ پچھانا جاتا ہے، جس میں پچھان، رہنما، مجموعی اور تجزیہ شامل ہوتا ہے۔
ہم مختلف بڑے مolecules کی پروٹین سٹرکچرل کاریکٹرائزیشن میں شریک رہے ہیں، جن میں ریکومبنٹ سبیونٹ واکسن، نانوبائیز/VHHs/ سینگل-ڈومین اینٹی بڈیز (sdAbs)، اینٹی بڈی فریگمنٹس، هارمونز/پیپٹائیڈز، سائٹوکائنز، گروتھ فیکٹرز (GF)، انزایمز، کالاجینز، اور دیگر شامل ہیں۔
N-glycosylation سائٹ اشغال کے لیے منظمیاتی ضروریات
ایچ آئی سی یو 6 بی کے رہنما کے مطابق، 'گلائیکو پروٹینز کے لیے، کاربوہائیڈریٹ کانٹینٹ (neutral sugars، amino sugars، اور sialic acids) کا تعین کیا جاتا ہے۔ علاوہ ازیں، کاربوہائیڈریٹ چینز کی ساخت، الیگوساکارائید پیٹرن (antennary profile)، اور پولیپیپٹائیڈ چین کے گلائیسیلیشن سائٹ(s) کو زیادہ سے زیادہ حد تک تحلیل کیا جاتا ہے۔
تحلیلی طریقہ
تجزیہ |
طریقے |
N-گلیکوسیلیشن سائٹ اکیپینسی |
ڈیگلائیکوسیلیز اور پروٹییز ڈجیسٹن کے بعد LC-MS |
روند
1. پروٹین کو چھوٹے پیپٹائیڈ فراگمنٹس بنانے کے لیے پروٹین ڈجیسٹن۔
2. endoglycosidase H یا PNGase F کے استعمال سے N-glycan کی رہائش۔ Endoglycosidase H N-linked glycans کے کور میں دو GlcNAc ریزیڈو کے درمیانی بونڈ کو توڑتا ہے، جبکہ PNGase F ایک glycoamidase ہے جو GlcNAc اور Asn کے درمیانی بونڈ کو توڑتا ہے، پوری شگر چین کو آزاد کرتا ہے اور Asn کو Asp میں تبدیل کرتا ہے جس سے ماس 1-Da کی وجہ سے بڑھ جاتی ہے۔
3. HILIC (Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography) کے ذریعہ N-glycopeptide کی وضاحت۔
4. N-linked glycosylation site occupancy کی تحلیل LC-ESI-MS/MS کے ذریعہ۔