Codon-optimalisatiestrategieën

Er zijn 64 genetische codons, waarvan er 60 coderen voor 20 aminozuren. Elk organisme dat wordt gebruikt voor eiwitexpressie of -productie (inclusief Escherichia coli, gist, zoogdiercellen, Pichia, plantencellen en insectencellen) vertoont een zekere mate van verschil of voorkeur in codongebruik. Codons die het meest frequent worden gebruikt in een gastheer worden optimale codons genoemd, terwijl die welke niet frequent worden gebruikt zeldzame of low-usage codons worden genoemd.

Codonoptimalisatie

Codonoptimalisatie omvat het aanpassen van een gensequentie door gebruik te maken van voorkeurscodons en het vermijden van codons met een laag gebruik of zeldzame codons, en vervolgens het aangepaste gen te verkrijgen door gensynthese. Dit herontwerp van genen wordt codonoptimalisatie genoemd.

Een geoptimaliseerde gensequentie kan de stabiliteit van de secundaire structuur van mRNA verbeteren en zo vertragingen in de vertaling, voortijdige beëindiging van de vertaling, verschuiving van het translationele frame en mismatches van aminozuren als gevolg van onvoldoende tRNA-pools voorkomen.

Optimalisatie is belangrijk omdat het de efficiënte voortgang van processen zoals gensynthese, vectorconstructie, transcriptie en translatie vergemakkelijkt.

Optimalisatiefactoren

Balanceren van GC-inhoud: Dit heeft invloed op de bindingsstabiliteit, de annealingstemperatuur en de eiwitopbrengst.

Verminderen van herhalende sequenties: Dit maakt de gensynthese minder moeilijk.

Aanpassen van de secundaire structuur van mRNA: Om haarspeldstructuren te vermijden die de translatie beïnvloeden.

Het elimineren van restrictie-enzym knipplaatsen:Om de integriteit van het gen te beschermen.

Codonvoorkeur: Optimaliseren van het donorgen op basis van de gastheer om de eiwitexpressie te maximaliseren.

Yaohai's steun

Voor genontwerp en -synthese zijn alleen eiwitexpressie en codonoptimalisatie niet voldoende. Verschillende methoden en programma's kunnen verschillende codon-geoptimaliseerde mRNA-sequenties ontwerpen en produceren. Op basis van de bovenstaande optimalisatiefactoren, gecombineerd met de officiële database en een samenvatting van jarenlange ervaring met gensynthese, heeft Yaohai Bio-Pharma zijn unieke codonoptimalisatiedatabase ontwikkeld. Het kan u gratis codonoptimalisatie en gensyntheseschemaontwerp bieden om de codonoptimalisatie van uw gensequentie te maximaliseren.

Yaohai Bio-Pharma heeft een complete set lineaire mRNA- en circulaire mRNA-synthesetechnologieën ontwikkeld om RNA van hoge kwaliteit te leveren, zoals sequentieontwerp en -optimalisatie, gensynthese, IVT, circularisatie, RNA-zuivering en LNP-inkapseling.

We zijn ook actief op zoek naar institutionele of individuele mondiale partners. Wij bieden de meest concurrerende verloning in de branche. Als u vragen heeft, neem dan gerust contact met ons op: [email protected]

Voor meer informatie over Yaohai Bio-Pharma verwijzen wij u graag naar onze website: www.yaohaibio-pharma.com