Codon Optimalisatie Strategieën

Er zijn 64 genetische codons, waarvan 60 20 aminozuren coderen. Elk organisme dat wordt gebruikt voor eiwitsynthese of -productie (inclusief Escherichia coli, gist, zoogdiercellen, Pichia, plantencellen en insectencellen) toont een zekere mate van verschil of voorkeur in codongebruik. De codons die het meest worden gebruikt door een gastheer worden optimale codons genoemd, terwijl de minder gebruikte codons zeldzame of laagfrequentie-codons heten.

Codonoptimalisatie

Codonoptimalisatie betreft het aanpassen van een genesequentie door voorkeurscodons te gebruiken en lage-frequentie- of zeldzame codons te vermijden, waarna de aangepaste gen wordt verkregen via genesynthese. Deze herschikking van genen wordt codonoptimalisatie genoemd.

Een geoptimaliseerde genesequentie kan de stabiliteit van de mRNA-secondaire structuur verbeteren, wat vertaaldelingen voorkomt, vroegtijdig vertaalbeëindigen, vertaalframeshifts en aminozuurmismatches door ontoereikende tRNA-pools.

Optimalisatie is van groot belang omdat het de efficiënte voortgang van processen zoals genetische synthese, vectorconstructie, transcriptie en vertaling ondersteunt.

Optimalisatiefactoren

Balansering van GC-inhoud: Dit beïnvloedt de bindingstabiliteit, annealingtemperatuur en eiwitrrendement.

Vermindering van herhalende sequenties: Dit verlaagt de moeilijkheidsgraad van genetische synthese.

Aanpassen van mRNA-secondaire structuur: Om haarpinstructuren te voorkomen die de vertaling beïnvloeden.

Uitschakelen van restrictie-enzym snijpunten : Om de integriteit van het gen te beschermen.

Codonvoorkeur: Optimalisatie van de donor-gene volgens de gastheer om het eiwitexpressie te maximaliseren.

Yaohai's ondersteuning

Voor genontwerp en -synthese zijn alleen eiwitexpressie en codonoptimalisatie niet voldoende. Verschillende methoden en programma's kunnen verschillende codon-geoptimaliseerde mRNA-sequenties ontwerpen en produceren. Gebaseerd op bovenstaande optimalisatiefactoren, in combinatie met hun officiële database, en samenvattend jarenlange ervaring in gen-synthese, heeft Yaohai Bio-Pharma een unieke codonoptimalisatiedatabase ontwikkeld. Deze kan u gratis codonoptimalisatie en gen-synthesesoftwareontwerp bieden om de codonoptimalisatie van uw gensequentie te maximaliseren.

Yaohai Bio-Pharma heeft een compleet systeem van lineaire mRNA- en circulaire mRNA-synthese technologieën opgebouwd om hoge-kwaliteit RNA te leveren, zoals sequentieontwerp en -optimalisatie, genesynthese, IVT, circularisatie, RNA-purificatie en LNP-omhulling.

Wij zoeken ook actief naar instellingen of individuen als wereldwijde partners. Wij bieden de meest concurrerende vergoeding in de industrie. Als u vragen heeft, aarzel dan niet om contact met ons op te nemen: [email protected]

Voor meer informatie over Yaohai Bio-Pharma, verwijs alstublieft naar onze website: www.yaohaibio-pharma.com