Strategi Optimasi Kodon

Terdapat 64 kodon genetik, di mana 60 di antaranya mengkodekan 20 asam amino. Setiap organisme yang digunakan untuk ekspresi atau produksi protein (termasuk Escherichia coli, ragi, sel mamalia, Pichia, sel tumbuhan, dan sel serangga) menunjukkan tingkat perbedaan atau preferensi tertentu dalam penggunaan kodon. Kodon yang paling sering digunakan dalam suatu inang disebut kodon optimal, sedangkan yang jarang digunakan disebut kodon langka atau kodon dengan penggunaan rendah.

Optimasi Kodon

Optimasi kodon melibatkan modifikasi urutan gen dengan menggunakan kodon yang disukai dan menghindari kodon dengan penggunaan rendah atau kodon langka, lalu memperoleh gen yang dimodifikasi melalui sintesis gen. Redesain gen ini dikenal sebagai optimasi kodon.

Sebuah urutan gen yang dioptimalkan dapat meningkatkan stabilitas struktur sekunder mRNA, mencegah penundaan terjemahan, penghentian dini terjemahan, pergeseran bingkai terjemahan, dan ketidaksesuaian asam amino akibat kurangnya kolam tRNA.

Optimisasi sangat penting karena memfasilitasi perkembangan efisien dari proses seperti sintesis gen, konstruksi vektor, transkripsi, dan translasi.

Faktor Optimisasi

Menyeimbangkan kandungan GC: Ini memengaruhi stabilitas ikatan, suhu annealing, dan hasil protein.

Mengurangi urutan berulang: Ini mengurangi kesulitan sintesis gen.

Menyesuaikan struktur sekunder mRNA: Untuk menghindari struktur hairpin yang memengaruhi translasi.

Menghilangkan situs potong enzim restriksi : Untuk melindungi integritas gen.

Preferensi kodon: Mengoptimalkan gen donor sesuai dengan inang untuk memaksimalkan ekspresi protein.

Dukungan Yaohai

Untuk desain dan sintesis gen, ekspresi protein dan optimasi kodon saja tidak cukup. Metode dan program yang berbeda dapat merancang dan menghasilkan urutan mRNA yang dioptimalkan kodon secara berbeda. Berdasarkan faktor-faktor optimasi di atas, dikombinasikan dengan basis data resmi mereka, serta merangkum pengalaman bertahun-tahun dalam sintesis gen, Yaohai Bio-Pharma telah mengembangkan basis data optimasi kodon uniknya. Ini dapat memberikan Anda optimasi kodon gratis dan desain skema sintesis gen untuk memaksimalkan optimasi kodon dari urutan gen Anda.

Yaohai Bio-Pharma telah mendirikan serangkaian lengkap teknologi sintesis mRNA linier dan lingkaran untuk menyediakan RNA berkualitas tinggi, seperti desain dan optimasi urutan, sintesis gen, IVT, pengikatan lingkaran, pemurnian RNA, dan encapsulasi LNP.

Kami juga secara aktif mencari mitra global, baik lembaga maupun individu. Kami menawarkan kompensasi paling kompetitif di industri. Jika Anda memiliki pertanyaan, silakan hubungi kami: [email protected]

Untuk informasi lebih lanjut tentang Yaohai Bio-Pharma, silakan merujuk ke situs web kami: www.yaohaibio-pharma.com