Strategi Optimasi Kodon

Ada 64 kodon genetik, yang 60 di antaranya mengkode 20 asam amino. Setiap organisme yang digunakan untuk ekspresi atau produksi protein (termasuk Escherichia coli, ragi, sel mamalia, Pichia, sel tumbuhan, dan sel serangga) menunjukkan beberapa tingkat perbedaan atau preferensi dalam penggunaan kodon. Kodon yang paling sering digunakan dalam inang disebut kodon optimal, sedangkan yang tidak sering digunakan disebut kodon langka atau jarang digunakan.

Optimasi Kodon

Optimasi kodon melibatkan modifikasi urutan gen dengan memanfaatkan kodon pilihan dan menghindari kodon yang jarang digunakan atau langka, lalu memperoleh gen yang dimodifikasi melalui sintesis gen. Desain ulang gen ini disebut optimasi kodon.

Urutan gen yang dioptimalkan dapat meningkatkan stabilitas struktur sekunder mRNA, mencegah keterlambatan translasi, penghentian translasi prematur, pergeseran kerangka translasi, dan ketidakcocokan asam amino karena kumpulan tRNA yang tidak mencukupi.

Optimalisasi penting karena memfasilitasi perkembangan proses yang efisien seperti sintesis gen, konstruksi vektor, transkripsi, dan translasi.

Faktor Optimasi

Menyeimbangkan kandungan GC: Hal ini memengaruhi stabilitas pengikatan, suhu pemanasan, dan hasil protein.

Mengurangi urutan berulang: Ini mengurangi kesulitan sintesis gen.

Menyesuaikan struktur sekunder mRNA: Untuk menghindari struktur jepit rambut yang memengaruhi penerjemahan.

Menghilangkan situs pemotongan enzim restriksi: Untuk melindungi integritas gen.

Preferensi kodon: Mengoptimalkan gen donor sesuai dengan inang untuk memaksimalkan ekspresi protein.

Dukungan Yaohai

Untuk desain dan sintesis gen, ekspresi protein dan optimasi kodon saja tidak cukup. Berbagai metode dan program dapat merancang dan menghasilkan sekuens mRNA yang dioptimalkan kodon yang berbeda. Berdasarkan faktor-faktor optimasi di atas, dikombinasikan dengan basis data resminya, dan merangkum pengalaman sintesis gen selama bertahun-tahun, Yaohai Bio-Pharma telah mengembangkan basis data optimasi kodon yang unik. Basis data ini dapat memberi Anda desain skema optimasi kodon dan sintesis gen gratis untuk memaksimalkan optimasi kodon sekuens gen Anda.

Yaohai Bio-Pharma telah menetapkan seperangkat lengkap teknologi sintesis mRNA linier dan mRNA sirkular untuk menyediakan RNA berkualitas tinggi, seperti desain dan pengoptimalan sekuens, sintesis gen, IVT, sirkularisasi, pemurnian RNA, dan enkapsulasi LNP.

Kami juga secara aktif mencari mitra global institusional atau individu. Kami menawarkan kompensasi paling kompetitif di industri. Jika Anda memiliki pertanyaan, jangan ragu untuk menghubungi kami: Alamat: [email protected]

Untuk informasi lebih lanjut tentang Yaohai Bio-Pharma, silakan merujuk ke situs web kami: www.yaohaibio-pharma.com