Strategije optimizacije kodona

Postoji 64 genetska kodona, od kojih 60 kodiraju 20 aminokiselina. Svaki organizam koji se koristi za izraz ili proizvodnju proteina (uključujući Escherichia coli, kvasce, mašinske ćelije, Pichia, biljne ćelije i insektske ćelije) pokazuje određeni stepen razlike ili preferencije u upotrebi kodona. Kodoni koji se najčešće koriste u domaćinu se nazivaju optimalnim kodonima, dok one koji se retko koriste nazivaju se redkim ili kodonima sa niskom upotrebom.

Optimizacija kodona

Optimizacija kodona podrazumeva modifikaciju niskog genomskog niza koristeći preferirane kodone i izbjegavajući kodone sa niskom upotrebom ili redke kodone, a zatim dobivanje modifikovanog gene putem sinteze gene. Ovaj preuređivanje gena naziva se optimizacija kodona.

Optimizovani niz gene može poboljšati stabilnost sekundarne strukture mRNA, sprečavajući kašnjenja u translaciji, prematureno završetak translacije, promenu translacionog frejma i nepravilnosti u aminokiselinama zbog nedostatka tRNA bazena.

Optimizacija je važna jer omogućava efikasno napredovanje procesa kao što su sinteza gena, konstrukcija vektora, transkripcija i tradukcija.

Faktori optimizacije

Ravnoteženje GC sadržaja: Ovo utiče na stabilnost vezivanja, temperaturu aneja i iznos proteina.

Smanjivanje ponavljanja nizova: Ovo smanjuje težinu sinteze gena.

Prilagođavanje sekundarne strukture mRNA: Da bi se izbegle šeširene strukture koje utiču na tradukciju.

Uklanjanje lokusa za isečak restriktivnih enzima : Da bi se zaštitila integritet gena.

Prednost kodona: Optimizacija davačkog gene prema domaćinu kako bi se maksimizirao izraz proteina.

Podrška Yaohai

Za dizajn i sintezu gene, samo izraz proteina i optimizacija kodona nije dovoljno. Različiti metodi i programi mogu da dizajnuju i proizvode različite optimizovane mRNA sekvence po kodonima. Na osnovu navedenih faktora optimizacije, kombinovano sa njihovom službenom bazom podataka, i sažimaći godišnje iskustvo u sintezi gena, Yaohai Bio-Pharma je razvila svoju jedinstvenu bazu podataka za optimizaciju kodona. Može vam pružiti besplatnu optimizaciju kodona i dizajn sheme za sintezu gene kako bi se maksimizirala optimizacija kodona vaše geneske sekvence.

Yaohai Bio-Pharma je uspostavila kompletni sistem tehnologija za sintezu linearnog i kružnog mRNA-a kako bi pružila visokokvalitetni RNA, kao što su dizajn i optimizacija sekvenci, sinteza gene, IVT, cirkularizacija, čišćenje RNA-a i LNP enkapsulacija.

Takođe aktivno tražimo globalne parcele, institucionalne ili individuelne. Ponudili smo najbolju kompenzaciju u industrijи. Ako imate bilo kakva pitanja, slobodno nas kontaktirajte: [email protected]

Za više detalja o Yaohai Bio-Pharma, molimo posetite naš sajt: www.yaohaibio-pharma.com