Стратегије оптимизације кодона

Постоје 64 генетска кодона, од којих 60 кодира 20 аминокиселина. Сваки организам који се користи за експресију или производњу протеина (укључујући Есцхерицхиа цоли, квасац, ћелије сисара, Пицхиа, ћелије биљака и ћелије инсеката) показује одређени степен разлике или преференције у употреби кодона. Кодони који се најчешће користе у домаћину називају се оптимални кодони, док се они који се не користе често називају ретки кодони или кодони са малом употребом.

Оптимизација кодона

Оптимизација кодона укључује модификацију генске секвенце коришћењем пожељних кодона и избегавањем кодона ниске употребе или ретких кодона, а затим добијање модификованог гена путем синтезе гена. Овај редизајн гена се назива оптимизација кодона.

Оптимизована секвенца гена може побољшати стабилност секундарне структуре мРНК, спречавајући кашњења у транслацији, прерано окончање транслације, транслациону померање оквира и неподударности аминокиселина због недовољног скупа тРНК.

Оптимизација је значајна јер олакшава ефикасно напредовање процеса као што су синтеза гена, конструкција вектора, транскрипција и транслација.

Фактори оптимизације

Балансирање ГЦ садржаја: Ово утиче на стабилност везивања, температуру жарења и принос протеина.

Смањење секвенци које се понављају: Ово смањује потешкоће у синтези гена.

Прилагођавање секундарне структуре мРНА: Да бисте избегли структуре укосница које утичу на превод.

Елиминисање места резања рестрикцијским ензимом: За заштиту интегритета гена.

Преференција кодона: Оптимизација донора гена према домаћину да би се максимизирала експресија протеина.

Иаохаи-јева подршка

За дизајн и синтезу гена, пука експресија протеина и оптимизација кодона нису довољни. Различите методе и програми могу дизајнирати и произвести различите секвенце мРНК оптимизоване кодоном. На основу горе наведених фактора оптимизације, у комбинацији са својом званичном базом података, и сумирајући године искуства у синтези гена, Иаохаи Био-Пхарма је развила своју јединствену базу података оптимизације кодона. Може вам пружити бесплатну оптимизацију кодона и дизајн шеме синтезе гена како бисте максимизирали оптимизацију кодона ваше секвенце гена.

Иаохаи Био-Пхарма је успоставила комплетан сет технологија линеарне мРНК и кружне синтезе мРНК како би обезбедила висококвалитетне РНК, као што су дизајн и оптимизација секвенце, синтеза гена, ИВТ, циркуларизација, пречишћавање РНК и ЛНП инкапсулација.

Такође активно тражимо институционалне или појединачне глобалне партнере. Нудимо најконкурентнију накнаду у индустрији. Ако имате било каквих питања, слободно нас контактирајте: ЦРО@иаохаибио.цн

За више детаља о Иаохаи Био-Пхарма, молимо погледајте нашу веб страницу: ввв.иаохаибио-пхарма.цом