RNA پریکرسرس کی بیچ کی تیاری کے بارے میں، ایک عام طریقہ لاب میں ترانسکرپشن (IVT) ہے۔ IVT ریکشن T7 RNA پالیمریز کی موجودگی میں نیوکلیوسائیڈ ٹرایفاسفیٹس (NTPs) کو ذریعہ کے طور پر استعمال کرتا ہے اور T7 پروموٹر کے ساتھ لائنیائزڈ پلاسمڈ DNA کو ٹیمپلیٹ کے طور پر استعمال کرتا ہے۔
لاب میں سرکلیشن کے طریقے کیمیائی جڑواں، انزیمی جڑواں اور permuted intron-exon (PIE) طریقہ شامل ہیں۔ کیمیائی جڑواں اور انزیمی جڑواں کم درجہ RNAs کی سرکلیشن کے لئے مناسب ہیں۔ جب فрагمنٹ 100 nt سے زیادہ ہوتا ہے تو سرکلیشن شرح بہت کم ہوجاتی ہے۔ مخالف طور پر، PIE نظام پر مبنی نیوکلیز طریقہ 8 کیلو بیس سیکوئنس کی سرکلیشن دستیاب کر سکتا ہے۔
گوانوسن ٹرائیفوسفیٹ (GTP) کی کیٹالیسٹ کے تحت، PIE ساخت کو اضافی انٹرون تسلسلات کا چکر لگتا ہے۔ چکر کی شرح کو بڑھانے کی مناسب راہ کے ساتھ، Yaohai Bio-Pharma 4 کب تک کے تسلسلات کو چکر دے سکتا ہے، جس کی چکر کارکردگی 80 فیصد سے زیادہ ہوتی ہے۔
RNA کی درجہ حیاتی چکر واپسی واکنش اس طرح بہتی ہے:
RNA پیشہ کو in vitro transcription سے بنایا جاتا ہے، اور PIE مول کو GTP کی کیٹالیسٹ کے تحت خود کو self-splicing کرتا ہے تاکہ circRNA بن جائے۔
عمل | سروس تفصیلات | دلواری دوران (کام کرنے والے دن) |
آزمائشگاہ میں ٹرانسکرپشن اور سرکلیشن | واکنش نظام تصدیق | 1-2 |
ان وٹرو ٹرانسکرپشن اور سائیکلیزیشن ریکشنز | ||
RNase R ڈائجیسٹن | ||
واکنش کی بہتری | ریکشن ترکیب، وقت کی بہترین کردن | 2-5 |
RNA سائکل کرنے کے لئے تکنیک میں 4 کب تک پہنچا جا سکتا ہے۔
معقول سیکوئنس اپٹیمائزیشن کی رistrیج کے ذریعے 80 فیصد سے زیادہ سائیکلنگ ریٹ حاصل کی جا سکتی ہے۔
تجربیاتی ماحول اور استعمالیات میں RNases کی شدید نگرانی کے ذریعہ، RNA کی تحلیل کو مؤثر طور پر روکا جاتا ہے۔
CircRNA کی لا بھاؤں میں سائیکلنگ اور انریچمنٹ
PIE نظام پر مبنی، Yaohai Bio-Pharma نے circRNA کی سیکوئنس کو اپٹیمائز کیا ہے، جس کے ذریعے agarose گیل الیکٹروفریسیس (AGE) کے ذریعے 80 فیصد سے زیادہ سائیکلنگ ریٹ حاصل کی جا سکتی ہے۔ RNase R کے استعمال سے circRNA کو انریچ کیا جاتا ہے، E-gel الیکٹروفریسیس کے نتائج ظاہر کرتے ہیں کہ لائنیئر RNA پریکرسر ڈائجسٹ ہوتا ہے، اور بعد میں مزید صاف کرنے کے بعد، زیادہ تر nicked circRNA ہٹا دی جا سکتی ہے۔ صاف کرنے کا حل Yaohai Bio-Pharma کے ذریعے خود شائع کیا گیا ہے۔
این وٹرو میں سرکولیٹنگ اور سرکی آر این اے کا غنیمت